如何做GO与KEGG分析-DAVID使⽤教程
这期番茄君为⼤家带来如何利⽤DAVID在线数据库做GO与KEGG分析。
1.点击⽂末“阅读全⽂”，获取DAVID在线数据库⽹址链接。打开后如下（部分）：
2.点击上图中红⾊框⾥的Start Analysis。如下：
3.上传基因。Step1: Enter Gene List有两个选项可以上传基因：第⼀种⽅法是在A: Paste a list的⽩⾊框⾥输⼊基因名字；第⼆种⽅法是利⽤B：Choose From a File上传⽂件。我们输⼊了57个和奶⽜产奶性状相关的基因（注意，所有基因排成⼀列后再输⼊，如果是上传word⽂档，也是将所有基因排成⼀列）。
4.点击Step2: Select Identifier下拉选项框，由于我们直接输⼊的就是基因的名字，所以这⾥选择
OFFICIAL_GENE_SYMBOL。
5.点击Step3:List Type的选项Gene List。
6.点击Step4:Submit List的Submit List。出现如下提醒，原因是我们没有选择物种，先点击确定，⾃动转到了List栏。
7.选择物种。因为我们输⼊的这些基因与奶⽜产奶性状相关，所以选择奶⽜Bos taurus，点击selected species。
如何做网址8.点击Backgroud，同样选择Bos taurus，点击use。
这样分析过程就完成了，接下来我们来看⼀下结果解析。
1.点击Functional Annotation Tool，跳转到Annotation Summary Results界⾯。
2.点击上图中Gene_Ontology前⾯的+号，即出现GO分析的三种类型BP， CC和 MF。
3.点击GOTERM_BP_FAT后⾯的Chart，即出现了这些基因聚集到的BP类型。
还可以选择不同的参数，点击Options前⾯的+号，有些⽂章以FDR为参考，选中FDR，点击Rerun Using Options即可。
同理，GO分析的CC和MF类型以及KEGG_PATHWAY分析的结果解析和上⾯是⼀样的。
DAVID数据库功能强⼤，远不⽌可以做GO和KEGG分析，还可以做基因ID之间的转换、ID转换为基因名称等等。当然做GO与KEGG分析的数据库还有很多很多，例如KOBAS以及其他在线数据库等等，各有优缺点，按需所取。

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