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使⽤STAR构建基因组⽐对索引--问题及解决⽅法
来吧，⽣信搞起！
⾸先拿到公司给的cleandata，使⽤STAR进⾏参考基因组⽐对，软件安装参考其他⽹站给的步骤；
下⾯是在建索引时遇到的问题，我是⼩⽩，啥都不懂，按照给的说明：
结果，⼀顿报错猛如虎。。。。⼩弟内⼼是崩溃的。
然后，⼤神⼀看，我靠，波浪线代表根⽬录，这玩意可不能随便⽤，尤其是我们⽤的是集。于是去掉波浪线，重新做。就出现下⾯的错误了，内存不⾜！！
⼤神终于看不下去了，于是帮我修改了语句：附⼤神的脚本
/public/home/liuxiaofeng/biosoft/STAR-master/bin/Linux_x86_64_static/STAR
--runThreadN 4 --runMode genomeGenerate
--genomeDir ref.fa （我之前的语句没有对索引⽂件命名）
--genomeFastaFiles /vol3/agis/zhoushaoqun_group/wangyantao/reference/S_aethiopicum_genome_
fasta --sjdbGTFfile /vol3/agis/zhoushaoqun_group/wangyantao/reference/S_aeth_gene.gff
据说，这语句也会爆出内存不⾜，于是乎：
/public/home/liuxiaofeng/biosoft/STAR-master/bin/Linux_x86_64_static/STAR
--runThreadN 4 --runMode genomeGenerate
--limitGenomeGenerateRAM 115005046144
--genomeDir ref.fa
--genomeFastaFiles /vol3/agis/zhoushaoqun_group/wangyantao/reference/S_aethiopicum_genome_fasta --sjdbGTFfile /vol3/agis/zhoushaoqun_group/wangyantao/reference/S_aeth_gene.gff
⼤神说，可以了，让我先去试试看吧

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