MEME从安装到使⽤
⼀、MEME安装
perl下载安装教程
最新版本的MEME依赖perl 5.10.1版本及以上，所以需要安装perl。
1. 下载perl并安装
安装follow:
tar zxvf
cd /path/to/your/perl
./Configure -des -Dprefix=/path/to/your/perl -Dusethreads
make  ##take a lot of time
make test
make install
vi .bash_profile
2.下载并安装MEME
安装follow：
tar zxf
cd meme_4.11.3
./configure--prefix=path/to/your/meme--with-url=--enable-build-libxml2--enable-build-libxslt
make
make test
make install
⼆、MEME的使⽤
1. 使⽤jaspar下载的pfm⽂件
2. 使⽤MEME内置jaspar2meme将pfm⽂件转为MEME可接收的motif⽂件
*注：安装perl太慢，所以直接使⽤服务器上的meme_4.9.0版本，2016版本的pfm⽂件需要，删除第⼀⾏及编号⾏，只保留count matrix部分，且只需要指定输⼊的⽂件格式以及⽂件所在的⽂件夹即可

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