分析测量图象软件Imagepro-Plus教程
一、入门
Imageproplus（IPP）的主要用途是分析测量图象。本人使用该程序进行生物图象分析有一段时间，写此帖的主要目的还是与大家交流使用心得，并总结一下使用方法。
如果你是刚接触IPP，最好先从本帖看起，并同时打开你电脑上的IPP程序照着操作。学会一个软件需要花一段时间的，两分钟不可能学会。两小时也太短。但我相信，照着我这几个帖子作下来，至少是可以用IPP干一点事情了。
打开IPP后的界面是这样的，该从何处下手呢？
既然是处理图片，当然是先要打开一张要处理的图片嘛
这张照片中的黄部分是免疫组化染的阳性表达成分。处理目标是通过测量图片中黄部分的"黄"度来反映相应蛋白表达的的“量”。对该图片进行观察，可以看到图片中主要有三种主要颜，一是染成蓝的细胞核，二是呈现出黄的胞浆，三是细胞间的空隙区域，
所以首先要把图片中呈现黄的区域给挑选出来，这部分区域是我们最感兴趣的地方，叫作AOI（area of interest）。AOI是IPP中最有用最重要的概念。如何能够准确地选取AOI就是使用IPP的关键操作。一旦准确地选取了AOI，下面的测量分析就好办了。对不同的图片，需灵活地使用各种适当的AOI工具，就这张图片来说，AOI是黄区域，因此用颜分类的AOI工具是最有效的。点击measure---count/size，弹出分类测量窗口
在窗口中选中manual，再点击select color，弹出颜选择窗口segmentation，这个工具是IPP最有特的颜选取工具之一。用好这个工具是使用IPP的要点。
对于目标颜鲜明的图片，用吸管工具是最简单的。点一下吸管图标，在目标区域点一
下，就可以选中该点的颜，当然一下是不可能完全选中所需要指定的全部区域，可以在未选中的地方接着再点，这样多次选取，直到把想选中的区域全部选中为止。在这张示例图中，选中的蓝细胞核部分被标上了红。用红框圈起来的四个工具按纽分别是：吸管、撒消上一步操作、橡皮擦、全部清除。下在的小方框里则是吸管位置的选取颜。
图片中被标上红的区域被定义为一个class，其中每一个独立的小区块被定义为这个class中的一个object。以此图为例，图中深蓝的部分是细胞核，因此所有的细胞核都被选中成一个class，其中每一个细胞核就是一个object。
选取完AOI后，点击close回到count/size窗口，下一步就可以对选中的object进行测量操作了。
点击count/size窗口中的measure菜单，点select measure，这是选择要进行何种测量操作，在弹出的测量选择窗口左侧列出了各种可用的测量选项，最常用的测量有：
area面积
image pro plusdensity（mean）平均光密度
diameter直径
IOD（integrated optical density）累积光密度
在相应的项目上点一下，该测量项目就被选到中间的窗口中了，同时关于该测量的详细说明会显示在最右边。如果想取消某个已选中的测量项目，则在左边窗口中该项目上再点击
一下就可以了。
选好了待测量的区域，也指定了测量项目，就可以进行测量统计了，点击一下测量选择窗口的OK纽，关闭这个窗口，就回到了count/size窗口，再点击一下count按纽，就可以看到程序在进行测量，稍等几秒钟即可读取测量数据。
分别点击count/size窗口中view菜单中的measurement data和statistics，就分别弹出这两个数据窗口。前者是这个calss中每一个object的测量数据，后者是这些测量数据的统计参数，如总数、平均值、累加、标准差等。本例中得到的就是每个细胞核的面积、平均光密度值、直径、累积光密度值。统计数据则可得到这张图片中所有细胞核的平均面积、平均

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