蛋白质结构预测Protein Structure Prediction
Haibo Sun
Department of Bioinformatics
MininGene Biotechnology
G h l
March 22, 2007
背景
结构分类：
z一级结构也就是组成蛋白质的氨基酸序列
z二级结构即骨架原子间的相互作用形成的局部结构，比如alpha螺旋,beta片层和loop区等
l h b t l
z三级结构即二级结构在更大范围内的堆积形成的空间结构
z四级结构主要描述不同亚基之间的相互作用。
结构测定的实验方法
z核磁共振
z X光晶体衍射两种。
一级结构级结构
预测基础预测基础：
z 实验：在体外无任何其他物质存在的条件下，使得蛋白质去折叠，然后复性，蛋白质将立刻重新折叠回原来的空间结构
z 物理学的角度讲，系统的稳定状态通常是能量最小的状态
二级结构
反向β－折叠
α－螺旋
β－转角
svg怎么转为pdf
三级结构
Turn or coil
Alpha-helix Beta-sheet
Loop and Turn

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