新冠核酸试剂内标的“内外源”之争!
近日,朋友圈在有关新冠核酸检测试剂内标的话题,引起了广泛的争议,事件起因于某临检中心要求“人源标本用内源性内参;非人源标本用外源性内参”。这可急坏了使用外源性内标的新冠核酸试剂厂家,毕竟环境标本才有多少!
什么是内标?
内标:内部检测标准,通过内标的设置,来监控提取和扩增过程,防止假阴性!
内标的设置有两种模式:
内源性内标:采用的是样本当中固有的人细胞中的管家基因,看家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的管家基因包括核酸检测结果阴性GAPDH、β-actin(BETA-actin)、18sRNA、B2M、HPRT和TBP等。
内源性内标的优点:既可以监测是否采集到足量细胞,又可以检测提取和扩增检测过程。
内源性内标的缺点:如果样品类型是口腔液,咽拭子等样品,管家基因的量很低可能导致实验不成立。如果检测的是环境样品则内参基因可能完全失效。
外源性内标:外加到提取溶液中的,人工设计合成的与模板扩增效率相似的一个基因片段。由各个生产企业制备,不同厂家之间不建议混用。
外源性内标的优点:更好的反映核酸提取及扩增检测过程(与真实病毒模板在基因序列上相近,扩增效率相近)。
外源性内标的缺点:不能监测是否采到足量的细胞,存在竞争性抑制的可能。
内标的设置一开始就是为了避免“假阴性”的出现,监控整个反应过程是否顺利进行,无论是内源性还是外源性的内标都可以满足这个需求。
临床上避免“假阴性”的措施
标本采集时要采集到含有病毒的细胞,理论上说,目前的注册试剂都包含检测人细胞或外源性的序列“内参”,如果是人源性的内参(如含有一个单联RNA分子的RNase P)。则其可以
监测是否采集到足够量的细胞,但是,采集部位不当,如采集口咽拭子时,采集深度不够,采集鼻咽拭子没有采到鼻腔深处,采集痰液时,并没有得到真正的痰等,也有可能采集到的细胞绝大部分都是不含病毒的细胞,即可能造成“假阴性”。通过加强对标本采集人员的培训,可以在很大程度上解决该问题。
如上所述,临床层面上的核酸检测“假阴性”也是无法完全避免的,那是不是我们就一点别的办法也没有呢?不是的,目前一个行之有效的办法,就是在患者病毒核酸检测阴性时,但临床又疑似为新冠病毒感染时,可以补充新型冠状病毒特异抗体检测。
参考资料:略
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