网络信息检索在药物信息中的发展与应用
摘要:伴随着计算机网络技术的不断发展,现代信息检索技术经历了由低级到高级的发展过程,目前正朝着智能化,多元化的方向发展。如何运用现代信息检索技术,获得药物信息,受到运来越多的药学工作者的重视。
关键词:因特网,信息检索,药物信息
因特网信息检索是现代网络技术带来的必然课题, 当网络成为信息世界中的
一种无所不在的承载体, 每一个检索者都可以随时随地截取和输送最新的各种
信息, 面对这样一个庞大无比、动态变化的网络信息, 要想获得某个用户所需特定信息, 必然还要依赖于因特网上的信息检索。而药学信息作为一种特殊的资源和财富, 合理开发利用将会产生良好的社会效益和经济效益,就网络药学资源丰富但利用率低的现状,阐述了信息资源整合的概念,介绍了各种网络药学信息资源,以及其各自的特点,并以具体的实例说明了资源整合的方法和步骤。
1.1 因特网简介
因特网是一个全球性的计算机网络,国内又把它称之为互联网络。也叫Internet。自1993年因特网引入我
国以来,先后建成了六个因特网国际出口信道,如中国科学院科技网(CSTNET)两条,国家教委科研网(CERNET),邮电部中国公用计算机互联网(CHINANET),电子部金桥网(CHINAGBN),国家科委的科技信息网(STINET),并且在数量上还在不断增加,带宽及速率也在增加。这些网络的建成在促进学术交流、获取最新信息方面发挥了很大的作用。中国医学信息网于1995年联接Internet网络,该网络在全国设立11节点,其中包括西藏地区。
1.2因特网提供的服务
1.2.1远程登录(telnet)
telnet服务资源可用来连接和使用因特网主机,连接建立之后,该用户所在的计算机就可以作为远程主机的终端一样使用。通过使用telnet,因特网用户可以与全世界的许多数据库、图书馆、文件库、大学信息系统以及其它信息资源建立联系。目前世界上许多大学图书馆、研究所、政府机构等向用户开放他们的数据库,对我们医药工作者来说,可通过Telnet进行医药文献查阅或获得任何所需信息。
1.2.2(electronic mail,E-mail)
允许向一个或一组因特网用户发送消息或,也可以用来接收和存储从其它用户发来的消息或邮件。优点是快速而可靠,使人们不再有时间和空间上的障碍。是为世界各地的因特网
用户提供的一种快速、简单和经济的通信或信息交换的方法,是因特网的重要应用之一。数以百万计的因特网用户都有自己的E-mail地址,E-mail改善了他们与世界范围内的同行或朋友们的通信能力,也为他们在信息获取、科研合作和专业发展等方面提供了新的非常重要的源泉、动力和手段。还支持主题范围甚广的电子讨论会,这种讨论会把持有不同见解的人组织在一起,讨论问题,共享成果。
E-mail还为因特网用户提供另外一种服务,那就是电子期刊(electronic journal)。虽然某些电子期刊需要某些特殊的软件才能显示他们的内容,但是更多的电子期刊是以文本方式分发给所有订户的。现在因特网上有许多与药学有关的电子期刊。
1.2.3邮递表(mailing list)
邮递表是由一系列E-mail地址构成的邮递清单,或者是说由许多邮件接受者的
用户名及其域名组成的花名册。当你把发往邮递表时,你的邮件就会自动发往这个邮递表的每一个成员。
1.2.4查询服务(finger)
查询服务包括以下3个方面:①可以用来显示因特网主机上任意用户的个人信息。②可以查看哪些人正在使用某个因特网主机。③可以与那些提供某些特殊信息而建立的因特网主机进行通讯,从而获得某种
信息如天气信息、地震信息等。
1.2.5匿名文件传输(FTP)
匿名文件传输FTP是因特网中最重要、应用最广泛的服务。利用这种服务你可以从Internet中的数以万计的分布在世界不同地方的计算机中免费拷贝到各种文件,这些文件包括各种各样的信息和软件。如果你需要某个应用软件,技术文件,需要阅读某种电子杂志,作为一个因特网用户,你就会发现,匿名FTP会对你的学习和工作给予极大的帮助。
1.2.6文档服务器(archie)
文档服务器是因特网资源的一种检索工具,它提供了一种在因特网环境下的以信息查询为目的的电子目录服务资源。这个数据库系统定期查阅因特网各文件库,确定可以提供给因特网用户的文件。这样,任何一个因特网用户,只要访问archie,给出需要查的文件名,就能知道该文件的出处了。
1.2.7新闻论坛(usenet)
新闻论坛是涉及全世界数百万人的为数众多的多样化综合性新闻或专题讨论组的总称。每一个讨论组(discussion group)都围绕某一个专题开展讨论。
1.2.8查访信息(gopher),广义信息服务系统(WAIS)和WWW
查访信息和广义信息服务系统在很大程度上方便了因特网用户。这两种软件是菜单式(menu)驱动程序,用户不必再键入长长的命令来完成某一操作,而只要以菜单的方法发出命令或请求,服务软件就会自动地去完成你指定的任务。WWW 则是另外类似的服务系统,但与gopher和WAIS不同,它是一种被称为“超级文本”为基础的信息检索系统,应用越来越广泛。
1.2.9联机交谈(talk)、IRC(internet relay chat)及其它
与电话相似,因特网同样也具有交互式(interactive)“同步通信”的能力。这种“同步通信”要求信息交换的双方同时进入因特网工作,而且信息交换是实时完成的。talk可以把你的计算机与其它用户的计算机连接起来,并可以把双方键入的内容实时的传给对方。这种对话的表现形式是通过键盘输入信息的同时你可以看到他(她)键入的内容,他(她)也可以实时地阅读到你键入的信息。
IRC是通过使用信道(channel)完成信息的交换。你在键盘上键入的内容会立即出现在那些恰好与你使用同一信道的各用户的屏幕上,有点象通常的电话会议。其它服务资源还有white pages,whois,布告栏系统BBS,电子杂志和多用户空间MUD等等。
1.3因特网信息检索的特点
1.3.1检索范围大, 因特网是一个全球性的网络, 信息资源分布在世界各地的服务器上, 可供检索的资源包括大量的主页、多种报纸、全文期刊、各种组织机构发布的信息、用户新闻以及原始技术报告等。
1.3.2 超文本检索, 因特网检索的结果是完全可以直接阅读和利用的Web 页面文献全文。而且只需要简单地用鼠标点击, 即可随意浏览。在多媒体的超文本中, 不但有文字、图片, 还可以有声音、动画、影视等形式的信息内容。
1.3.3 界面友好, Web 信息检索工具界面丰富友好, 使用户的检索相当方便, 十分易于操作。Web 信息检索途径较多甚至还可按相关性程度对检索结果进行排序输出。检索时, 只需按一定规则输入检索式, 在发出检索命令后即可获得检索结果, 通常检索结果包括文献页面的题名、内容简介、URL 地址等, 并可据此获得更详细的超文本页面。
1.3.4 良好的反馈能力和快速响应能力, Web 信息检索工具通常采用全文单词标引的方式, 将因特网上的文本页面进行全文单词的自动倒排, 建立庞大的索引数据库。这些Web 信息检索的索引数据库, 常常24 小时就更新, 大量的基于全文的单词倒排工作, 通常是借助于有关的程序软件自动运行的, 因而具有良好的信息反馈功能和快速响应功能。
1.4 因特网信息检索的发展趋势
因特网信息检索近年来的发展已使信息检索的面貌大大改观: 检索行为已不再是信息管理与服务人员的专利,任何因特网用户都可以实施网络检索; 许多数据库都通过因特网加强了其可存取性, 使信息存储与检索的费用急剧下降; 通过因特网来获取各种信息已成为一种普遍、日常的活动, 并将成为人们检索信息
、利用信息的一种主要手段和形式。因特网信息检索的发展主要体现在进一步改进、完善检索工具和检索技术, 以提高检索服务的质量。因此,对因特网的未来发展趋势我们可以从以下几个方面来探讨。
1.4.1数据库的进一步完善
在网络信息检索的早期发展中, 众多搜索引擎均在数据库收录标引网页的规模数量和检索速度上展开竞争; 而目前大家都意识到某个搜索引擎能检索10 万个或100 万个记录对用户来说并不是最重要的, 目前, 人们对因特网所关心的是它能否迅速、准确地到针对自己检索问题的确实答案, 而不是检索到记录的多少, 因此在数据库方面将发生如下变化:过去, 一般网络检索工具只依赖其自己建立的数据库来供检索服务, 检索范围有限。而现在某些著名的搜索引擎, 如Lycos 等通过各种渠道逐步完善自己的网站, 提供各种服务。还有的搜索引擎之间创建了合作伙伴关系, 如果在自己的数据库中没有检索出与提问相匹配的答案, 会自动转向与有合作伙伴关系的数据库中继续检索。如在Yahoo 网站上的检索者会得到某些在AltaVista 中检索出的结果, Netscape 的用户会见到Excite 的检索结果页。从而扩大了其检索范围, 改进了检索结果。
1.4.2 网络检索工具的智能化
随着网络用户对检索的精度、检索效率的要求不断提高, 网络检索工具开始重视提高其在检索功能及检索服务上的智能化程度。
1.4.
2.1自动索引软件的智能化
如著名的搜索引擎Infoseek 正在致力于研究、改善其自动索引软件的智能化水平。所谓“聪明的蜘蛛”(SmarterSpider) , 将不再只是简单、机械、无识别能力的检索和标引网页, 而将能够对网页内容的相关性及该网页所包含的链接的质量等做一些判断。
1.4.
2.2智能检索与智能搜索引擎
智能检索是信息检索领域的发展趋势, 因特网信息检索也顺应了这一潮流的发展。近年来还有被称为智能搜索引擎(intelligent search engine) 的网络检索工具出现, 比较有代表性的如Ask Jeeves。像著名的搜索引擎AltaVista 就采用了它的技术, 开设了“Ask AltaVista”的智能检索服务。
1.4.3 用户友好性的进一步提高
21 世纪的科技创新都要强调以人为本, 因特网信息检索工具的发展也不例外。前面所述网络检索工具在数据库上的改进和完善。也都是在面向用户多样化的检索需求,提供高质量的信息服务上所做的积极努力。网络检索工具在提高用户友好性方面所做的具体改进有:
1.4.3.1改善用户检索界面
一些搜索引擎的研制者在观察、分析了用户实际的检索行为后发现, 一般用户的检索都是以输入简单几个检索词的方式进行的, 很少有用户使用复杂检索, 如布尔检索、限制检索等。为鼓励和引导用户改善检索效果, 搜索引擎在改善用户检索界面, 提供更多的检索选择上做了某些改进。如许多流行的搜索引擎(AltaVista、Excite 等) 都向用户提供了分类导引式的网络资源指南。
1.4.3.2更好的检索结果提供方式
检索结果的显示、提供方式直接影响着用户对信息的吸收和利用, 有的搜索引擎提供了一些更先进的方式来显示检索结果。如Excite 等将所有来源于不同站点的检索结果分组汇集在一起, 供用户去获取。因特网作为一种新的媒体形式, 近年来在对信息内容的过滤、筛选方面也有过一些争论。如: AltaVista 提供的“家庭过滤器”(family fil2ter) 和lycos 推出的保护性检索“search guard”等。
2. 药学信息
药学信息包含药学领域所有知识数据, 既包括与药物直接相关的药物信息, 如药物作用机制、药动学、药物不良反应、药物相互作用、药物经济学等, 也包括与药物间接相关的信息、如疾病变化、耐药性、生理病理状态等, 还包括药品流通信息、药政信息。
2.1网络药学信息的特点
2.1.1 药学信息发布迅速、获取方便众所周知, 现在获取信息的途径多种多样, 如杂志、报纸和新闻报导等, 但与网络相比, 都有些滞后, 尤其是新药的开发。网络的信息发布迅速, 可使信息在瞬间便为大家所知, 不受空间和时间的限制, 获取信息更新、更全。
2.1.2 药学信息丰富、广泛
网络蕴含着大量的药学信息, 涉及药学的各个学科。网络上有许多药学网站, 可提供大量药学普及知识、药学科研进展、药学发展动态等信息资源。药学工作者可通过进行信息的传递、交流和咨询, 通过网络可以进行药学远程教育, 网络可使药学信息资源最大程度地实现共享。
2.1.3 药学信息的持续性
网络信息储存量巨大, 只要你不将所发布的信息删除, 就可被人查阅, 以便于药
学工作者的查询, 可最大限度地发挥信息资源的作用。
2.2 检索方法
2.2.1 分类检索
网络上有一些优秀的检索工具, 将普通信息进行分类, 每一大类下又分成若干小类, 用户可根据自己的需求直接到各个类目下查, 然后层层展开, 检索所需信息。目前设有药学类目的优秀检索工具主要有: ①FDA( 美国食品与药品管理局) , 该网点将大量的药物方面的信息分为12 大类: 食品、人用药物、生物学、兽用
药物、化妆品、医疗器械与放射健康、自由论坛、野外作业、儿童与烟草、毒理研究、医学信息、健康与人类服务部。②Yahoo: 该网站是目前最流行的检索工
具之一,将收集的信息按主题分为14 个类目, 如教育、健康、科学等。其中健康类目又分为医学、疾病、药物与保健等小类目。③Infoseek: 该网点将所收信息
分为17 个类目,如计算机、教育、生活、健康等, 其中健康类目下还分为疾病、药物、保健等小类目。另外Megellan InternetGuide、Excite 等也具有分类检索功能, 其中的健康、医药等类目中都包含药物类信息。
2.2.2 关键词检索
关键词检索是目前最快速方便的检索方式, 网络上检索引擎中一般都设有关键
词检索功能, 如: Altavista、WebCrawler、Lycos 等检索工具。利用网上检索引擎, 将需要查信息的关
键词输入检索框内, 然后按下检索按钮, 即可检索出所需信息。此外不同网站提供的检索机制不同, 在关键词检索的基础上还可以进行高级检
索和加权检索, 可根据检索者的实际需要进行选择, 使检索结果更精确。
2.3 药学资源数据库
数据库是检索药学信息资源及查新的主要工具之一, 有题录文摘型数据库和全
文型数据库。
2.3.1 题录文摘型数据库
《中国生物医学文献数据库》(CBMdisc) 、《中文生物医学期刊文献数据库》(CMCC) 、《中国药学文摘》(CPA) 、美国《生物学文摘》(BA) 、荷兰《医学文摘》( EmBase 数据库) 、《科学引文索引》( SCI) 等数据库, 以上国内外几大数
据库提供了大量有关药学发展、药物使用情况的信息。
2.3.2全文型数据库常用的全文数据库包括万方、维普和中国医院知识仓库CHKD 期刊全文库、ProQuest、OVID 和Sciencedirect。
2.4 药学信息网站
2.4.1 国外主要网站
http: //v/是美国FDA ( Food and DrugAdministration) 的网址, 主页有Food、Human Drugs、Biologics、Animal Durgs、Medical Product Reporting、ToxicologyResearch 等13 项。在Human Drugs 项目内可查到审批药物的资料。http: //bi.v/pubmed/是美国国家医学图书馆的PubMed 主页, 包括Medline、Premedline、Articlesnotin Medline of Premedline 等, 可查阅到较Medline 提供的更多资料, 所以这网址也叫MedlinePlus。它既可提供更多药品的资料, 也提供针对疾病的方面的资料(Clinical Queries) 。
/是一个内容极为广泛、实用的药学网址, 计有16 项。
spider软件例如, 在药学院校项内, 提供了世界40 多国家的药学院校网址; 在杂志和书籍
项内, 提供上百种杂志的链接。http: //www.drugstore/是药品销售性质的网站,可查名称、规格、剂量、价格。该网站也可用来查阅药品的一般技术资料。http: //www.drugtopics/links.html 是提供美国药学各领域网站连接的网址, 内容十分丰富。有8 大类: Pharmaceutical Companies& Products、Informational Programs、Continuing Education、National & InternationalPharmacy Associations、Stat
e Pharmacy Associations、Government Health Agencies、Student Information、PharmacySchools。在Govermantal Health Agencies 项中可到FDA、NIH 等相关
资料。在Pharmacy School 项内提供美国78 所药学高校的网址。
www.idrug/medical/index.asp 是反映药学领域最新信息的网址, 它
信息量大、更新速度快,内容包括: 药物信息、疾病中心、医疗机构、药学高校、讨论组等。主要有Drug Info、Disease Info、Health News、Health Info、Health Orgs、Medical Refs、Med Schools 等12 部分。
http: //www.herbnet/是提供有关植物药的网址,有多个栏目: 例如, 草药
世界、协会、植物园、出版物等。
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