SPM使用简介
         
        一、Spm的安装与启动：
          先安装matlab，然后将spm复制到matlab下的一个文件夹（Spm2需要和matlab6.0或以上版本配合使用）。
          启动matlab，首先set path，然后在matlab命令窗口中输入spm即可启动，然后选择fmri，也可以直接输入spm fmri
         
          二、Spm数据处理概要
          先将所得数据进行空间预处理（对齐，平滑，标准化等），然后进行模型估计（将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积，所得结果与全脑象素信号进行相关分析），最后察看结果。
         
slice中文          三、Spm数据处理一般步骤
          1、转换数据
          dicom格式转换为img文件，将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。
          2、Slice timing
          校正系列成像中层与层获得时间的不同，使一个TR中的各层获得时间一致（如都在一个TR的开始），相当于afni中tshift所做的工作。
          3、Realign（相当于afni中的registration）
          分两步：
          1）coregister，将每个session的第一个scan与第一个session的第一个scan进行比较，然后将每个sessioni中的其他scan与本session中的第一个scan进行比较，得到每个filen
ame.img文件的转换参数，生成filename.mat文件，同时为每个session生成一个对齐参数（realignment （重排）parameters），文件名为realignment_params_*.txt
          2）reslice，用filename.mat文件对filename.img重新切片，生成rfilename.img文件。并可依选择生成一个平均象，名为meanfilename.img。
          4、Normalize(正规化，规格化，标准化)
          选用realign步骤中得到的平均象与模板进行比较，获得进行标准化的参数，参数文件命名为filename_sn3d.mat，然后依据此参数文件对每个img文件进行标准化，生成文件nfilename.img.
          5、Smooth
          推荐为象素大小的两至三倍。
          6、Fmri models
          依据提示填入刺激出现的间隔与时间，并选择实验涉及类型，然后进行估计。
          估计结果生成spm.mat等文件，保留在当前工作目录
          7、Result
          选中刚才生成的spm.mat文件，定义constrast，看结果。

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