翻译蛋白的基因序列提交NCBI教程
说明：在上传编码蛋白质的基因到NCBI时，定义基因的CDS区段是非常重要的一步，也是大多数学生所迷茫和不会的地方。那么，在基因序列上传时，大家还在发愁序列的CDS 编码区段是从多少位碱基到哪吗？这篇教程给大家详细的演示了如何定义手中序列的CDS 区段，轻松上传序列。
注：大家都知道像ITS，18S，28S等这些序列片段不是基因，它们是不翻译蛋白质的，这个教程教大家如何提交能翻译蛋白的基因序列。bank文件
提交通道：通过NCBI内的BanKIt进行提交。
1.打开NCBI主页，在搜索框内输入“BankIt”，见下图1
2.搜索结果见下图2
3.进入后进行登录，用NCBI的账号和密码登录（注：如果没有，可以使用邮箱注册），
登录后的页面见下图3，根据需要点击相应按钮开始进入序列提交界面（注：也可点击下图红框圈出的位置）
4.我们需完成如下图4中的8个步骤，即可完成提交
5．完成第一步的Contact Information后，第二步的Reference我们需要填写如下图5的信息
6．Sequencing Technology选项，填写如下图6
7．Nucleotide（这一步需要我们准备上传的序列文件）
a.序列文件类型为fasta文件，我们需要先对序列进行定义（也就是介绍该序列，可以
先将自己的序列在NCBI里Blast一下，然后再点开Query Cover（可理解为覆盖度）和Per. Ident（可理解为匹配度）都非常高的那个网上的参考序列，然后复制该参考序列的定义内容即可，见下图7-1）
b.然后粘贴成为我们手中的序列定义，见下图7-2（注：不要忘记将菌株号改为自己的
菌株号，序列开端一定要是“>Seq1 [organism=genus species]”，其中的Seq1可以用你的菌株号，也可以随意编号，只要你自己知道就可，方括号[xxxx]内填写自己序列的菌的拉丁名）
c.准备好序列后，我们勾选如下图7-3的选项
d.然后这个序列就可以载入了（点击Upload file），或者直接粘贴该序列，见下图7-4
单个序列的界面
注：这一步上传序列时你也可以将多条序列，包括不同基因的序列都可以准备到同一个fasta文件里，载入后再选择“Batch”（批量提交的意思），界面见下图7-5
e.点击Continue
8. Organism这一项需输入咱们的菌拉丁名，见下图8
9. Submission Category 如下图9
10. Source Modifiers 这一项需要我们输入一些有关咱们的菌的信息，如采集国家，采集人，，isolate，时间等信息，见下图10
11. Features (Overview) 这一项是非常重要的一项，也是大家经常有问题的一项，一定要认真学。编码蛋白的序列提交界面需勾选如下选项，再点击Add，见图11-1

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