如何获得基因序列?——在NCBI中查目的基因实例
1. 根据文献
    通过阅读文献,到你感兴趣的基因,根据文中提到的该基因在NCBI中的ID号,直接打开bi.v , 在All Databases后的下拉框中选择Nucleotide,把基因 ID号输入Search前面的文本框中,点“Search”,就可以到该基因了。
举例说明,例如:在2003年JBC的文章(Conditional Knock-out of Integrin-linked Kinase Demonstrates an Essential Role in Protein Kinase B/Akt Activation)中出现了“calreticulin (GenBank accession number gi 16151096)”,那么把“16151096”输入Search前面的文本框中,点“Search”,就可以到该基因了(当然包括基因序列等相关信息),见下图。
检索结果界面下图,可以看到GenBank号为AY047586的CALR基因的相关信息了。
 里面有很多基因的信息,再往下是基因的的核酸序列(ORIGIN之后)。
基因的翻译区(CDS)点击 CDS即可得到。
下图标示的褐区域序列即为基因的编码区序列。
这里需要指出一下,在显示基因的页面右侧有一个LinkOut to external resource,里面是与该基因相关的链接,对于该基因的相关研究是很有用的。
 
mvc实例如果你只想获得序列(例如去设计PCR引物的时候),那就可以选择FASTA,这样就得到了FASTA格式的序列文件,没有其他数字和格式的干扰。
 
这就是FASTA格式的序列:
2. 根据已经获得的基因的相关信息进行查
    如果只是知道基因的名字,怎么查序列呢?还是举例说明,比如研究的基因名称是人的VEGF基因,那么怎么在NCBI中到它呢?首先打开bi.v/
All Databases的下拉框中选择Gene,然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”,点击Search...  

版权声明:本站内容均来自互联网,仅供演示用,请勿用于商业和其他非法用途。如果侵犯了您的权益请与我们联系QQ:729038198,我们将在24小时内删除。