(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利说明书 | ||
(10)申请公布号 CN 103074431 A (43)申请公布日 2013.05.01 | ||
(21)申请号 CN201310012196.1
(22)申请日 2013.01.14
(71)申请人 山东大学齐鲁医院
地址 250014 山东省济南市历下区文化西路107号
(72)发明人 王传新 张欣 王海燕
(74)专利代理机构 济南圣达知识产权代理有限公司
代理人 彭成
(51)Int.CI
C12Q1/68
C12N15/11
权利要求说明书 说明书 幅图 |
(54)发明名称
检测结直肠癌血清miRNA-128的专用引物、试剂盒及方法 | |
(57)摘要
本发明公开了一种检测结直肠癌血清miR-128的专用引物,包括miR-128的逆转录引物和检测引物、U6的逆转录引物和检测引物、miRNA-16的逆转录引物和检测引物,如SEQ IDNO:1~9所示。一种检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒,包括上述引物,以及RNA分离液。一种检测结直肠癌血清miR-128表达量的方法,步骤如下:(1)将待检测的血清标本与等体积RNA分离液混合,16000g离心10分钟,分离上清液;(2)RT-PCR扩增;(3)制作标准曲线(4)计算:得出基因的校正起始拷贝数Q;将miR-128的Q值与内参基因U6、miR-16的Q值的几何平均数相比,得到miR-128的相对表达量。本发明的检测方法,为结直肠癌的早期发现、早期提供了重要的参考依据。 | |
法律状态
法律状态公告日 | 法律状态信息 | 法律状态 |
权 利 要 求 说 明 书
1.一种检测结直肠癌血清miR-128的专用引物,其特征在于:包括:
(1)miR-128的逆转录引物和检测引物,逆转录引物的序列如SEQ ID NO:1所示,检 测引物的序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示:
miR-128-RT:
5’-GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACAAAGAG-3’;
miR-128-F:5’-GGCTCACAGTGAACCGGT-3’;
miR-128-R:5’-GTGCAGGGTCCGAGGT-3’;
(2)U6的逆转录引物和检测引物,逆转录引物的序列如SEQ ID NO:4所示,检测引物 的序列如SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6所示:
U6-RT:GTGCTCGCTTCGGCAGCACATATAC;
U6-F:GTGCTCGCTTCGGCAGCACATATAC;
U6-R:AAATATGGAACGCTTCACGAATT;
(3)miRNA-16的逆转录引物和检测引物,逆转录引物的序列如SEQ ID NO:7所示,检 测引物的序列如SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示:
miRNA-16-RT:
5’-GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACCGCCAA-3’;
生活中常见的数据库应用miRNA-16-F:5’-CGCCTAGCAGCACGTAAATA-3’;
miRNA-16-R:5’-GTGCAGGGTCCGAGGT-3’。
2.一种检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所述的 检测结直肠癌血清miR-128的专用引物,以及RNA分离液;所述RNA分离液由吐温20、三 羟甲基氨基甲烷、乙二胺四乙酸、牛血清白蛋白和水组成,其中,浓度如下:吐温20:2.5%; 三羟甲基氨基甲烷:50mmol/L;乙二胺四乙酸:1mmol/L;牛血清白蛋白:1%。
3.根据权利要求2所述的检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒,其特征在于:所述 检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒还包括PCR反应液,PCR反应液由Syber Green Ⅰ 荧光染料、DNA聚合酶、dNTPs、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、氯化钾、氯化镁和水组成。
4.根据权利要求3所述的检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒,其特征在于:所述 反应液中各物质的浓度如下:DNA聚合酶:100U/ml,dNTPs:0.2mM;氯化镁:6mM;三 羟甲基氨基甲烷盐酸盐:16.5mM;氯化钾:89.3mM。
5.权利要求1所述的检测结直肠癌血清miR-128的专用引物在定性检测血清miR-128或 定量检测血清miR-128表达量中的应用。
6.权利要求2或3或4所述的检测结直肠癌血清miR-128的专用试剂盒在定性检测血清 miR-128或定量检测血清miR-128表达量中的应用。
7.一种检测结直肠癌血清miR-128表达量的方法,其特征在于:步骤如下:
(1)将待检测的血清标本与等体积RNA分离液混合,离心,分离上清液;
(2)RT-PCR扩增:向上述分离的上清液中加入SEQ ID NO:1所示的miR-128的逆转录 引物,进行反转录得cDNA,取cDNA为模板,加入SEQ ID NO:2、3所示的引物以及PCR 反应液,进行PCR扩增,检测样本阈值Cq;同时,从人结直肠癌细胞株HT29细胞中提取 miRNAs,逆转录成cDNA,10倍梯度稀释,作为校对样本,在每个PCR反应板中进行检测, 记录Cq值;内参基因U6、miR-16的RT-PCR扩增,除引物采用相对应的逆转录引物和检测 引物外,方法相同;
(3)制作标准曲线:上述检测完成后,拷贝数以10为底取对数作为横坐标,Cq值为纵
坐标作图,绘制标准曲线,计算斜率S,然后根据公式E=10<sup>(-1/S)</sup>-1,计算扩增效率E;
(4)计算:选中样本和校对样本检测孔,应用实时荧光定量PCR仪的随机软件得出样 本阈值Cq(T)和校对样本阈值Cq(C),根据公式Q=(E+1)<sup>-△Cq</sup>,△Cq=[Cq(T)-Cq(C)], 得出基因的校正起始拷贝数Q;将miR-128的Q值与内参基因U6、miR-16的Q值的几何平 均数相比,得到miR-128的相对表达量。
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