【重磅】GeneSpringGX中⽂教程(⼀)2016-11-01
本期开始freescience数据团队将定期推送GeneSpring的中⽂说明书,为零基础的⼩伙伴学习基因芯⽚分析提供帮助。
⾸先,Gene Spring ⽬前国内尚⽆中⽂版的公开说明书,是各位⽆私付出时间的⼩伙伴才有这⼀国内⾸发,让我们对参与翻译的志愿者表⽰衷⼼的感谢,其次,本教程仅供学习GeneSpring使⽤,绝不可⽤于商业⽬的,因此造成的后果由其⾃⾏承担,与Freescience⽆关。最后,请⼤家使⽤试⽤版或者正版来分析数据,尊重知识产权。
⼩编将对教程进⾏校对,任何问题都可以加⼊freescience⼤数据进⾏交流和讨论。
1. 引⾔
本章简要介绍GeneSpring GX,包含⽤户界⾯的含义及各种专业术语,对相关的数据和分析流程进⾏概述。
2. 启动GeneSpring GX
启动GeneSpring GX,⾸先要激活了许可证,⽽且许可证必须是有效的。从开始菜单启动,或者从Windo
ws桌⾯图标,或者Mac和Linux桌⾯图标启动。在⾸次启动GeneSpring GX时,系统会显⽰⼀个demo项⽬。在随后的启动中,会显⽰⼀个启动对话框。此对话框允许您创建⼀个新的项⽬,列表中可以打开已有项⽬或者最近使⽤项⽬。如果你不希望启动对话框,可以取消对话框。您可以恢复启动对话框,通过⼯具- 选项 - 其他 - 启动对话框。
3. GeneSpring GX⽤户界⾯
含有实验数据的GeneSpring GX视图
主窗⼝包括四个部分 - 菜单栏,⼯具栏,显⽰窗格和状态⾏(the Menubar, the Toolbar,the Display Pane ,the Status Line)。
显⽰窗格中包含了数据集的视图,以及算法结果。显⽰窗格分为三个部分:中央的GeneSpring GX界⾯,左边的项⽬导航,GeneSpring GX⼯作流程浏览界⾯和右边的图式窗⼝。
4. GeneSpring GX桌⾯
桌⾯容纳所有载⼊GeneSpring GX中与每个实验有关的视图。每个窗⼝都可以进⾏独⽴地操作并且控制其⼤⼩。不重要的窗⼝可以被最⼩化或不显⽰。桌⾯显⽰的视图是激活状态的。
5. 项⽬导航
项⽬导航在界⾯最左边,包含项⽬中所有的实验数据。每个实验都有其导航窗⼝。默认情况下实验导航窗⼝包含了⼀个样本⽂件夹,⼀个解释(实验设计)⽂件夹,⼀个分析⽂件夹和⼀个收藏⽂件夹(⼦⽂件夹)。
6. ⼯作流程浏览界⾯
⼯作流程窗⼝
⼯作流程浏览显⽰了实验中可⽤的分析操作列表。⼯作流程浏览按照分析流程来排布,有利于数据分析。
7. 图⽰窗⼝
图⽰窗⼝显⽰了当前显⽰的图式。右键单击图⽰窗⼝显⽰复制或导出图例的选项。复制图例将它复制到Windows剪贴板,从⽽能使⽤Control-V粘贴到其他Windows应⽤程序。若将保存的图例导出,可以选择其中的⼀种标准格式(JPG,PNG,JPEG等)导出。
8. 状态栏
如下所述,状态栏被分为四个信息区域。
状态图标显⽰视图状态的图标。有些视图可以为缩放或选择模式。当前模式相应的视图图标将显⽰在这⾥。
状态区域显⽰当前视图的详细信息。如果⼀个视图被选择为启⽤,状态区域显⽰总⾏数或列数和显⽰选中的实体/条件的数⽬。如果视图不能被选择,它会显⽰该视图⽆法选择。
滚动信息区域此区域显⽰了当前视图中光标位置信息。(例如,散点图中点的X,Y坐标,表格中的⾏列等)。
内存监视器这将显⽰分配给Java进程的内存总量和当前使⽤的内存量。通过左键点击左侧的垃圾箱⼦图标,您可以清除内存,使⽤该⼯具将减少当前使⽤的内存。
好了,先说到这⾥,⼤家各⾃练习消化⼀下哦~
spring启动流程面试回答FS数据挖掘主编
赵忻艺,将⼤数据应⽤于医学科研,主要包括临床医学数据的挖掘、收集、整理和利⽤(标准化和科学化的数据库),医学分⼦⼤数据的整理、利⽤及研究(基因、蛋⽩及代谢)。特别针对肿瘤个体化的基因测序和数据快速处理,寻个体化的分⼦标志物、药物靶标和⽅案。⽬前,已建⽴浙⼤⼤数据挖掘团队,旨在降低研究者学习⼤数据的门槛,推动⼤数据共享与研究协作,发表更⾼质量的研究成果,
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