python光谱的去基线处理
光谱的去基线处理是一种常见的数据预处理技术,可以去除光谱中由于背景或其他因素引起的基线扰动,从而提高光谱的信噪比和准确度。在Python中,有多种方法可以实现光谱的去基线处理,以下是其中一些常用的方法:
1. 多项式拟合法
多项式拟合法是一种简单而有效的去基线方法,它通过在整个光谱范围内拟合一个多项式函数来估计基线,并从光谱中去除基线。在Python中,可以使用numpy库中的polyfit函数进行多项式拟合,例如:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成模拟数据
x = np.linspace(400, 700, 301)
y = 0.1*(x-500)**2 + 20*np.sin((x-550)/50*np.pi) + 50*np.random.randn(301)
# 多项式拟合
p = np.polyfit(x, y, deg=5)
base = np.polyval(p, x)
linspace函数python# 去除基线
y1 = y - base
# 绘图
fig, axes = plt.subplots(nrows=2, figsize=(8,6))
axes[0].plot(x, y)
axes[0].set_title('Original spectrum')
axes[1].plot(x, y1)
axes[1].set_title('Baseline corrected spectrum')
plt.tight_layout()
plt.show()
```
2. Savitzky-Golay平滑法
Savitzky-Golay平滑法是一种广泛使用的光谱去噪和去基线方法,它通过采用滑动窗口的方式对光谱进行局部多项式拟合,并用拟合结果替代原始数据点,从而提取出光谱的特征信号。在Python中,可以使用scipy库中的savgol_filter函数进行Savitzky-Golay平滑,例如:
```python
import scipy.signal as signal
# Savitzky-Golay平滑
y2 = signal.savgol_filter(y, window_length=31, polyorder=3)
# 去除基线
y3 = y - y2
# 绘图
fig, axes = plt.subplots(nrows=2, figsize=(8,6))
axes[0].plot(x, y)
axes[0].set_title('Original spectrum')
axes[1].plot(x, y3)
axes[1].set_title('Baseline corrected spectrum')
plt.tight_layout()
plt.show()
```
3. Asymmetric Least Squares (ALS)法
Asymmetric Least Squares (ALS)法是一种基于最小二乘法的光谱去基线方法,它通过利用正则化技术对光谱信号进行平滑处理,从而有效地去除基线的扰动。在Python中,可以使用PyChem库中的als方法进行ALS法去基线,例如:
```python
import pychem as pc
# ALS法去基线
y4 = pc.baseline(x, y, als=True, lam=10**6, p=0.1, niter=10)
# 绘图
fig, axes = plt.subplots(nrows=2, figsize=(8,6))
axes[0].plot(x, y)
axes[0].set_title('Original spectrum')
axes[1].plot(x, y4)
axes[1].set_title('Baseline corrected spectrum')
plt.tight_layout()
plt.show()
```
通过以上例子,我们可以看出,不同的去基线方法可能效果有所不同,具体选择哪种方法需要根据实际情况来判断。
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