anaconda中怎么sh_linux基础Anaconda安装及Conda使⽤教
程
1.Anaconda下载
Anaconda Linux版本下载地址清华镜像源
2.Anaconda安装
安装代码
bash Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh
安装过程注意事项:
⾸词bash也需要输⼊,⽆论是否⽤的Bash shell。
安装过程中,看到提⽰“In order to continue the installation process, please review the license agreement.”(“请浏览许可证协议以便继续安装。”),点击“Enter”查看“许可证协议”。python默认安装路径
在“许可证协议”界⾯将屏幕滚动⾄底,输⼊“yes”表⽰同意许可证协议内容。然后进⾏下⼀步。
安装过程中,提⽰“Press Enter to accept the default install location, CTRL-C to cancel the installation or specify an alternate installation directory.”(“按回车键确认安装路径,按'CTRL-C'取消安装或者指定安装⽬录。”)如果接受默认安装路径,则会显⽰“PREFIX=/home//anaconda<2 or 3>”并且继续安装。安装过程⼤约需要⼏分钟的时间。
安装器若提⽰“Do you wish the installer to prepend the Anaconda<2 or 3> install location to PATH in your
/home//.bashrc ?”(“你希望安装器添加Anaconda安装路径在/home//.bashrc⽂件中吗?”),建议输⼊“yes”。注意:路径/home//.bash_rc中“”即进⼊到家⽬录后你的⽬录名。如果输⼊“no”,则需要⼿动添加路径,否则conda将⽆法正常运⾏。
当看到“Thank you for installing Anaconda<2 or 3>!”则说明已经成功完成安装。
验证安装结果。
可选⽤以下任意⼀种⽅法:
在终端中输⼊命令condal list,如果Anaconda被成功安装,则会显⽰已经安装的包名和版本号。
在终端中输⼊python。这条命令将会启动Python交互界⾯,如果Anaconda被成功安装并且可以运⾏,则将会在Python版本号的右边显⽰“Anaconda custom (64-bit)”。退出Python交互界⾯则输⼊exit()或quit()即可。
在终端中输⼊anaconda-navigator。如果Anaconda被成功安装,则Anaconda Navigator将会被启动。
3.1 验证conda已被安装
conda list
终端上将会以conda 版本号的形式显⽰当前安装conda的版本号。如:conda 4.5.11
3.2 卸载conda
rm -rf ~/anaconda2
3.3 管理环境
创建新环境
conda create --name wgs
or
#安装python3环境
conda create --name wgs python=3.7
or
#安装python2环境
conda create --name wgs python=2.7
切换环境
source activate wgs
退出环境⾄root
source deactivate
显⽰已创建环境
conda info --envs
删除环境
conda remove --name wgs --all
导⼊导出环境
如果想要导出当前环境的包信息可以⽤
#将包信息存⼊yaml⽂件中:
conda env export > environment.yaml
当需要重新创建⼀个相同的虚拟环境时可以⽤conda env create -f environment.yaml
3.4 管理conda包
查可供安装的包版本
conda search vcftools
获取当前环境中已安装的包信息conda list
安装包
conda install vcftools
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