MOL分子文件格式
MOL文件格式是一种用于描述分子结构的文本文件格式。它通过一系列的ASCII字符来表示分子的原子、键和其他相关信息。MOL文件格式是化学领域中常用的文件格式之一，广泛应用于化学信息系统、计算化学和药物研发等领域。在本文中，我们将详细介绍MOL分子文件格式的结构和相关信息。
一、MOL文件的基本结构
MOL文件由多行组成，每一行代表一个原子或键的信息。通常，MOL文件的第一行包含了分子的名称或标识符，接下来的几行描述了分子的属性信息，例如分子的公式、分子量和立体化学信息等。随后的行表示每个原子的详细信息，包括原子符号、坐标和所属的分子等。
二、MOL文件的格式要求
1. 第一行：分子的名称或标识符，长度不超过80个字符。
2. 第二行：分子的属性信息，例如分子的公式、分子量等。
ascii文件夹怎么创建3. 第三行：空行。
4. 第四行至倒数第二行：原子的信息，每行包含11个字段。
  - 字段1-10：原子的坐标，使用10个字符表示，分别是x、y、z坐标的值。
  - 字段11：原子的符号。
5. 倒数第一行：键的信息，每行包含7个字段。
  - 字段1-3：连接的原子编号，用于表示键的连接关系。
  - 字段4：键的类型。
  - 字段5-7：额外信息，例如键的立体化学信息等。
6. 倒数第二行之后：可选的其他信息，例如分子的能量、电荷等。
三、MOL文件的示例
下面是一个示例的MOL文件，用于表示甲烷（CH4）分子的结构和相关信息。
  CH4 Example
  5 4 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000
    -0.349  -0.173  -0.607 C  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    -0.329  -0.163  0.493 H  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    -0.155  -0.565  -0.729 H  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    -0.155  0.231  -0.793 H  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      0.988  -0.079  -0.001 H  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1  2  1 0  0  0  0
    1  3  1 0  0  0  0
    1  4  1 0 

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