软件应用
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重要应用化学软件和数据库导论解析
◆姚凤宇
现今重要应用化学软件与数据库是化学绘图中应用的重要技术手段之一,文章中主要针对几种常见、具有代表性的化学软件,以及数学库进行了分析。
1 重要应用化学软件
1.1 2MDL 软件
起源于美国的MDL 公司在早期推出了2MDL 化学绘图软件,并且该软件的最新版本已经更新到1S1S/Draw2。该软件主要是针对学术、个人家庭进行使用,并且可以免费从网站进行下载。运用此软件可以进行极为复杂的生化分子、聚合物分子等一些化学结构式的绘制,所绘制出的化学结构图能够随意剪切、粘贴至Word 、Excel 以及PowerPoint 等一些软件中。1S1S/Draw2.5软件呈现的操作界面是所有化学绘图软件中较为简单的一种。操作界面中的Text 键,主要可以应用于图形中文字的编写;Templa
tes 键则可以用于模板库窗口的打开,更多可以弹出270多类分子、官能团、箭头图以及轨道图等一些模板,以此为操作用户提供模板服务,并再次基础上也可以创建化学结构式、反应式以及化学图形起始框架;除此之外,Chemistry 键主要可以应用在对结构式错误的检验,以及摩尔质量、所包含各个元素百分含量的检验。在操作窗口左侧便是通用的工具键,比如移动图形键、旋转图形键、图形擦除键以及添加原子、官能团键等。
MDL 系列化学软件产品,MDL 的公司中也有一些其他类型的化学软件产品,其中还包括了 MDLMetaboliteDatabase ,即代谢数据库、MDLToXieityDatabase ,即毒性数据库、MDLComprehensiveMedieinalChemist ,即医药化学数据库等软件。
(二)BIO 一RAD 系列软件
(1)KnowltAllAeademie Edition 系列软件
Blo 一RAD 公司在21世纪初宣布该化学软件可免费进行使用,KAE 软件不仅可以进行化学结构绘图的绘制出版,同时也可以对波谱进行分析。一般的受众体可以从公司的网站中进行免费的下载。KnowltAllAca-demicEdition 占空间内存82.IMB,该软件内存是其他相同类型免费软件的十几倍。该软件所包含的子软件主要有以下几种:
1)Drawlt 软件。
该软件主要应用于2D 与3D 结构的绘制。 2)RePortlt 软件
该软件主要应用于包含结构式、光谱、谱图以及数据表实验报告的书写,软件内也配备了100余种玻璃仪器,以此可以进行实验装置图的绘制,除此之外还包括了250余种的化工流程图符,例如工业炉、压缩机以及热交换器等一些图符,以此可以进行化工流程图的绘制。
3)Analyzelt 软件
该软件主要运用波谱解释工具进行IR 、Raman 波谱的分析。 4)SymApps 软件
该软件主要应用于针对分子对称性的计算与展示的动画化,另外还包含了对于计算结构式内所有原子键长、键角与二面角。
(2)KnowltAll Analytical Edition
Blo 一RAD 公司中波谱类型的软件自20世纪长期开始便已经连续三年在相关行业杂志的读者评选获得最佳波谱软件的荣誉,由此可见,该波谱分析版本中的相关功能也十分齐全。
1)SearchIt&Minelt 软件
数据库编辑软件
运用该软件时,用户只需要输入化学名称、结构、子结构以及波谱、波峰中的其中一种的数据,便可以在IR 、NMR 、Ms 、uv/Vis 、GC 、Raman 等相关的参考数据库中进行所需要的波谱图搜索,除此之外,
用户也可以在此基础上建立属于自己的波谱分析数据库。
2)RefineltIR&Raman 软件
该软件为提供了不同形式的应用于滑顺曲线、基线校正等方面的工具,以此对用户所搜索的波谱图质量进行校正,提升科研报告的美观度。
3)ProeessltMS 软件
该软件可以在其中输入40余种常规格式MS 数据信息,通过观察与选择在谱的运行过程中进行MS 扫描数据的分析。
(3)KnownAll 系列其他软件 1)IUPACNamelt 软件
在该软件中只需要输入结构式,便可以将该结构式系统IUPAC 名称输出。
2)IUPACDrawlt 软件
在该软件中只需要提供系统IUPAC 名称,或是药品属名,软件便可以自动的输出结构式。
3)AnalyzeltIR&Raman 软件
在该软件中包含了200余种官能团以及百余个解释频率可以进行访问,在此基础上对IR 与Raman 光谱官能团进行分析。
2 化学数据库
2.1 NIST 数据库
在相关的国家标准以及技术研究院中所提供的化学免费检索数据库,比如其中所包括NxsT 网络化学手册,进行检测时可以免费的检索到17000余种化合物红外光谱、16000余种化合物质谱、2000余种化合物紫外光谱以及5000余种化合物电子、振动光谱。除此之外,还可以在其中搜索到8000余种有机、无机的热化学数据、9000余种具备化学反应的热化学数据以及14000余种离子能量分布数据。进行搜索的项目除了可以为化学分子式,也可以是化学名称以及注册号。另外,一些其他种类的免费检索数据库还包括了MST 原子光谱数据库以及NIST 反应动力学数据库等。
2.2 SRC 数据库
Syraeuse 研究公司的属性为非盈利性组织,自成立以来主要为大众提供技术方面的服务,以此在相关行业中享有较高声誉。其中,具有物理性质的PHYSPROP 数据库是该公司旗下免费检索的数据库其中一种,PHYSPROP 数据库内包含了25000余种化学结构式与名称。其中涵盖的实验数据也包含了10000余个熔点、6000余个沸点、6500余个水溶解度、2800余个蒸气压、1700余个Pka 以及2000余个亨利定律系数。
3 结束语
文章中针对重要应用化学反应软件以及数据库导论,对其进行了分析,希望能够通过文章中的分析,能够使应用化学软件得到广泛的推广余应用,以此推动我国科研教学的不断发展。
作者简介:
姚凤宇(1986-)男,大学本科,工作单位:山东翔通工程技术服务有限公司,毕业于衡水学院,研究方向:应用化学。
(山东翔通工程技术服务有限公司 山东 265701)
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