五折交叉验证K折交叉验证,python代码到底怎么写
五折交叉验证:把数据平均分成5等份,每次实验拿⼀份做测试,其余⽤做训练。实验5次求平均值。如上图,第⼀次实验拿第⼀份做测试集,其余作为训练集。第⼆次实验拿第⼆份做测试集,其余做训练集。依此类推~
但是,道理都挺简单的,但是代码我就不会写,⽐如我怎么把数据平均分成5份?我怎么保证每次实验的时候,数据都是这么划分的?本来⼀般的训练时,把数据按6:2:2分成训练集、验证集和测试集,在训练集上训练图像,验证集上保存最佳模型,测试集⽤来最后的测试。现在交叉验证没有验证集了,怎么保存模型?以下为⼤家⼀⼀解答。
1.把数据平均分成K等份
使⽤KFold类。
del_selection.KFold(n_splits=5, *, shuffle=False, random_state=None) sklearn提供的这个函数就是⽤来做K折交叉验证的。提供训练集/测试集索引以分割数据。将数据集拆分为k折(默认情况下不打乱数据。
参数介绍
n_splits:int, 默认为5。表⽰拆分成5折
shuffle:bool, 默认为False。切分数据集之前是否对数据进⾏洗牌。True洗牌,False不洗牌。
random_state:int, 默认为None。当shuffle为 True 时,如果random_state为None,则每次运⾏代码,获得的数据切分都不⼀样,random_state指定的时候,则每次运⾏代码,都能获得同样的切分数据,保证实验可重复。random_state可按⾃⼰喜好设定成整数,如random_state=42较为常⽤。当设定好后,就不能再更改。
使⽤KFold类需要先初始化,然后再调⽤它的⽅法实现数据划分。它的两个⽅法为:
get_n_splits(X=None, y=None, groups=None)
返回交叉验证器中的拆分迭代次数
split(X, y=None, groups=None)
⽣成索引,将数据拆分为训练集和测试集。
X: 数组,形状为:(n_samples, n_features)
其中n_samples是样本数,n_features是特征数。
y: 数组,形状为(n_samples,), default=None。可要可不要
return:train和test的索引,注意返回的是每个集合的索引,⽽不是数据
举例1:设置shuffle=False,每次运⾏结果都相同
del_selection import KFold
import numpy as np
X = np.arange(24).reshape(12,2)
y = np.random.choice([1,2],12,p=[0.4,0.6])
kf = KFold(n_splits=5,shuffle=False)  # 初始化KFold
for train_index , test_index in kf.split(X):  # 调⽤split⽅法切分数据
print('train_index:%s , test_index: %s ' %(train_index,test_index))
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结果:5折数据的索引
train_index:[ 3  4  5  6  7  8  9 10 11] , test_index: [0 1 2]
train_index:[ 0  1  2  6  7  8  9 10 11] , test_index: [3 4 5]
train_index:[ 0  1  2  3  4  5  8  9 10 11] , test_index: [6 7]
train_index:[ 0  1  2  3  4  5  6  7 10 11] , test_index: [8 9]
train_index:[0 1 2 3 4 5 6 7 8 9] , test_index: [10 11]
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通过索引去获取数据和对应的标签可⽤:
fold1_train_data, fold1_train_label = X[train_index], y[train_index]
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举例2:设置shuffle=True,每次运⾏结果都不相同
举例3:设置shuffle=True和random_state=整数,每次运⾏结果相同
因此,实际使⽤的时候建议采⽤案例3这种⽅式,即可保证实验可重复,有增加了数据的随机性。
举例4:真实案例数据划分
我有⼀些的三维数据⽤来做分割,图像和label分别放在不同的⽂件夹。如:
└──根⽬录
└── image
│├──
││──
│└──
── label
│├──
││──
│└──
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images1 = sorted(glob.glob(os.path.join(data_root, 'ImagePatch', 'l*.')))
labels1 = sorted(glob.glob(os.path.join(data_root, 'Mask01Patch', 'l*.')))
images2 = sorted(glob.glob(os.path.join(data_root, 'ImagePatch', 'r*.')))
labels2 = sorted(glob.glob(os.path.join(data_root, 'Mask01Patch', 'r*.')))
data_dicts1 = [{'image': image_name, 'label': label_name}
怎样写代码 自己做编程for image_name, label_name in zip(images1, labels1)]
data_dicts2 = [{'image': image_name, 'label': label_name}
for image_name, label_name in zip(images2, labels2)]
all_files = data_dicts1 + data_dicts2
# 把image和label创建成字典,统⼀放在列表⾥
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all_files是⼀个包含所有数据的列表,但列表⾥的每⼀个数据⼜是⼀个字典,分别当image和label的数据地址。
我们对all_files的数据进⾏五折交叉验证:
floder = KFold(n_splits=5, random_state=42, shuffle=True)
train_files = []  # 存放5折的训练集划分
test_files = []    # # 存放5折的测试集集划分
for k, (Trindex, Tsindex) in enumerate(floder.split(all_files)):
train_files.append(np.array(all_files)[Trindex].tolist())
test_files.append(np.array(all_files)[Tsindex].tolist())
# 把划分写⼊csv,检验每次是否相同
df = pd.DataFrame(data=train_files, index=['0', '1', '2', '3', '4'])
<_csv('./data/Kfold/train_patch.csv')
df1 = pd.DataFrame(data=test_files, index=['0', '1', '2', '3', '4'])
<_csv('./data/Kfold/test_patch.csv')
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我们把数据集的划分保存到csv⾥⾯,以防⽌代码改动丢失了原本的划分⽅法。
数据集划分好了,就可以进⾏训练和测试了。每⼀次拿划分好的⼀折数据就⾏。
# 五折分开train, 每次拿⼀折train 和 test
train(train_files[0], test_files[0])
test(test_files[0])
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在train和test⽅法⾥⾯,肯定要写好对应的dataloder, 因为我们刚只是把数据的名字进⾏了划分,并没有加载数据集。
通常的做法⾥,会循环5次,运⾏⼀次代码,把五折的结果都做出来。但是我们这种写法的好处在于,你想训练第⼏折,就把索引值改⼀下就是,不需要⼀下⼦全部训练完。只要你不动代码,你⼀年后再训练,数据集的划分都不会变。变了也不怕,我们把划分已经保存成csv了
当然,这只是⼀种写法,如果有更好的⽅案,欢迎留⾔探讨~~
2.没有验证集了,怎么保存最佳模型
这是我之前⼀直好奇的问题。因为,如果不做交叉验证,那么我会根据测试集上的指标保存最佳模型。⽐如以下代码是在验证集上完成的。
if metric > best_metric:
best_metric = metric
best_metric_epoch = epoch + 1
save_dir = 'checkpoints/checkpoint_04264/'
if not ists(save_dir):
os.makedirs(save_dir)
save_path = save_dir + str(epoch + 1) + "best_metric_model.pth"
torch.save(model.state_dict(), save_path)
print('saved new best metric model')
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但是,现在,没有验证集了,我是根据训练集上的指标保存模型呢,还是根据测试集上的指标?这个
问题,没有统⼀答案,两者做法都有。正因为没有统⼀答案,那我们可以选择对⾃⼰最有利的答案啊。⽐如,写论⽂的时候,根据测试集上的结果保存模型,那肯定得到的结果更好啊。
⽽且,还有⼀个⼩tips, ⽤交叉验证的得到的结果通常⽐按6:2:2划分训练集验证集测试集上的结果要好。想想是为什么
作者:zh智慧
作者:九州编程
链接:www.imooc/article/317856
来源:慕课⽹

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