肠道细菌四⼤“门派”——拟杆菌门，厚壁菌门，变形菌门，放线菌门⼀般在肠道菌健康检测报告中，会有主要菌属构成⽐例，类似下图：
图源：⾕⽲肠道菌健康检测报告
我们可以看到图中列举了拟杆菌门，厚壁菌门...等。很多⼩伙伴拿到报告之后，对于这些细菌门表⽰
困惑。
这些细菌门都代表了什么意思？
某个细菌门⽐例⾼了会怎么样？
某个细菌门⽐例⾼，是好是坏？
是不是与某些疾病相关？
.......
实际上，这⼏⼤类门的丰度和构成⽐例变化与⼈类健康和疾病发⽣息息相关。
两个主要门类，拟杆菌门和厚壁菌门，构成⼈类肠道细菌的⼤部分。七岁以后，拟杆菌和厚壁菌之
间的⽐例相对稳定，⽽它们⽐例紊乱可能会导致肥胖和糖尿病等代谢综合征。
本⽂，我们就给⼤家详细介绍⼀下这其中最常见的⼏⼤细菌门：
bacterium拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、放线菌门。
为什么选这四⼤细菌门？
依据⾃然属性分类，⼈类肠道菌已经鉴定出细菌的⼏⼗个门，包括：拟杆菌门、厚壁菌
门、变形菌门、放线菌门、疣微球菌门、梭杆菌门、蓝藻菌门、螺旋体门等。
但是其中98%的肠道菌可以归属为前四类，拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和放线菌门，⼤
多数⼈这4个门的菌占据肠道细菌数量的99%。
了解这四⼤细菌门，可以说你对⼤部分⼈体内肠道菌的有了基本的了解。
01 拟杆菌门
Bacteroidetes
▲拟杆菌：⾰兰⽒阴性菌
不形成孢⼦厌氧菌杆
菌▲
它们具有外膜、肽聚糖层和细胞质膜。它们⽆氧呼吸的主要副产物是⼄酸、异戊酸和琥珀酸。
△拟杆菌参与⼈体结肠中许多重要代谢活动
包括碳⽔化合物的发酵、含氮物质的利⽤以及胆汁酸和其他类固醇的⽣物转化。⼤多数肠道细
菌是糖酵解的，这意味着它们通过碳⽔化合物分⼦的⽔解获得碳和能量。
△多糖是拟杆菌的主要能量来源
据估计，只有约 2% 的单糖通过上消化道到达结肠。因此，单糖可能不是拟杆菌的主要能量来源。然⽽，来⾃植物纤维的多糖，如纤维素、⽊聚糖、阿拉伯半乳聚糖和果胶，以及植物淀粉，如直链淀粉和⽀链淀粉，在结肠中更为普遍。
多糖还被证明可以诱导来⾃拟杆菌的多种葡糖苷酶活性，包括负责海带多糖降解的β-1,3-葡糖苷酶活性
以及多种α、β-1,4 和α、β--1,6 ⽊糖苷酶和葡糖苷酶活性。⼤部分拟杆菌成员蛋⽩质组包括⽔解这些多糖的蛋⽩质。
△是肠道⽣态系统中⾮常成功的竞争者
表现出相当⼤的营养灵活性和对宿主和肠道环境施加的压⼒做出反应的能⼒。很难说肠道拟杆菌是否对宿主产⽣负⾯或正⾯影响。拟杆菌能够通过预防可能定植和感染肠道的潜在病原体感染来使宿主受益。由但是，在短链脂肪酸存在下，弱酸性 pH 值会抑制⽣长。诸如脆弱拟杆菌之类的致病物种已经开发出逃避宿主免疫系统的策略。
△拟杆菌有好有坏
作为多糖降解联盟的成员，它们有助于从膳⾷纤维和淀粉中释放能量，它们很可能是丙酸盐的主要来源；然⽽，它们也参与了蛋⽩质分解过程中有毒产物的释放，这个体的成员有⼀些可能有助于抑制炎症的活动，但他们也有可能促进炎症，有些是已知的机会性病原体。
将复杂的多糖转化为可⽤化合物的能⼒可能使拟杆菌⽐必须依赖其他能源的细菌更具竞争⼒。
此外，拟杆菌实际上会刺激肠道内壁产⽣岩藻糖基化聚糖。这种细菌还会刺激新⽣⼉上⽪的⾎管⽣成（⾎管的形成），从⽽增强⼈体对营养物质的吸收。因此，拟杆菌细菌与其宿主有着复杂且普遍有益
的关系——只要它们保留在肠腔内。
△拟杆菌属与饮⾷有关
⽬前，拟杆菌门中研究得最充分的，包括拟杆菌属拟杆菌属和普⽒菌属以及卟啉单胞菌属。它们是专性或严格的⾰兰⽒厌氧菌，它们的组成和代谢活动在很⼤程度上受饮⾷调节。拟杆菌与⾼脂肪和蛋⽩质的摄⼊量有关，⽽普雷沃⽒菌与富含植物的饮⾷（⾼⽔平的复合碳⽔化合物和⽔果和蔬菜的摄⼊量）有关，因此，拟杆菌属和普雷沃⽒菌属物种在⼈体内具有其特定的栖息地，因为它们⼤多数是拮抗的。
△影响⾷物的代谢
其活动在⾷物和饲料成分的分解和转化中起着重要作⽤。在⼈类结肠中，拟杆菌属被认为对植物和宿主来源的多糖的代谢做出了⾮常重要的贡献，⽽普⽒菌属有助于瘤胃中植物材料的利⽤。这两个属在蛋⽩质代谢中都起着重要作⽤，并且可能也参与致癌物和异⽣物质的代谢。
在患有⾮酒精性脂肪性肝炎的⼈类中，微⽣物组成中拟杆菌的⽐例较低，这与⾼脂肪饮⾷和BMI ⽆关。
△拟杆菌属是最耐氧的厌氧菌之⼀
能够耐受⼤⽓中的氧⽓浓度长达 3 天。在腹内感染开始期间，氧耐受性被认为允许细菌在腹腔的含氧组织中存活，直到⼤肠杆菌和其他协同⽣物能够降低感染部位的氧化还原电位。
△拟杆菌离开肠道会导致多种感染和脓肿
这些感染和脓肿可能发⽣在全⾝，包括中枢神经系统、头部、颈部、胸部、腹部、⾻盆、⽪肤和软组织。组织。⼴泛接受的腹部感染模型如下：肠壁破裂，细菌菌渗⼊腔内，需氧菌（感染中最活跃的部分）如⼤肠杆菌开始初步破坏组织并降低含氧菌的氧化还原电位（低氧化还原电位有利于厌氧菌⽣长），厌氧拟杆菌开始复制，然后拟杆菌主导感染。
除了腹泻和脓肿，已知拟杆菌与脑膜炎和分流感染病例有关，尤其是在⼉童中。任何通常没有被拟杆菌定植的组织在接触到含有拟杆菌的粘液或其他材料时都有可能被感染。
此外，拟杆菌作为胃肠⼿术过程中的感染源是⼀个巨⼤的问题。因此，必须采取适当措施和有效的⼿术引流，以降低感染风险。
△主要的致病拟杆菌属是脆弱拟杆菌属
脆弱拟杆菌与B. distasonis、卵形双歧杆菌、B. thetaiotaomicron和B. vulgatus⼀起，在临床感染中发⽣得最多，它们⼏乎普遍对青霉素具有抗药性，主要是由于产⽣了β-内酰胺酶。这些细菌普遍存在于
胃肠道区域并且是⼤多数腹腔内感染的原因，例如直肠周围脓肿和褥疮溃疡。
当从结肠释放到⾎液中时，脆弱拟杆菌迅速繁殖，导致菌⾎症。
如果脆弱拟杆菌被引⼊到腹腔，可能导致腹膜炎，和/或腹部脓肿。
△与拟杆菌属相关的感染
1. 泌尿⽣殖系统感染，包括产褥脓毒症
2. ⼿术或腹部损伤后的阑尾炎和腹部感染和伤⼝感染
3. 脑、肺和肝脓肿通常为混合菌感染
4. 褥疮，通常与其他病原微⽣物混合
5. B. melanogenicus导致⽂森特⼼绞痛的组织损伤和炎症
6. 腹内感染：80%以上由脆弱拟杆菌引起
7. 妇科感染：脆弱拟杆菌的多种微⽣物厌氧菌感染经常引起脓肿
8. 最常与脆弱拟杆菌相关的⽪肤和软组织感染
9. 呼吸道感染：包括⾮脆弱类杆菌在内的多种微⽣物感染
以下为本门当中⽐较著名的种属及其所属的纲⽬
拟杆菌⽬ Bacteroidales
嗜细胞菌⽬ Cytophagales
黄杆菌⽬ Flavobacteriales
拟杆菌纲 Bacteroidia
黄杆菌属 Cytophagia
鞘氨醇杆菌 Sphingobacteriia
拟杆菌科 Bacteroidaceae
噬纤维菌科 Cytophagaceae
黄杆菌科 Flavobacteriaceae
普雷沃⽒菌属 Prevotella
拟杆菌属 Bacteroides
红棕⾊单胞菌属 Porphyromonas
产黄菌属 Flavobacterium
⾦黄杆菌属 Chryseobacterium
普⽒菌 Prevotella copri
粪便拟杆菌 Bacteroides stercoris
单形拟杆菌 Bacteroides uniformis
平常拟杆菌 Bacteroides plebeius
脆弱拟杆菌 Bacteroides fragilis
类杆菌 Bacteroides xylanisolvens
多形拟杆菌 Bacteroides thetaiotaomicron
杜雷拟杆菌 Bacteroides dorei
迪⽒副拟杆菌 Parabacteroides distasonis
粪拟杆菌 Bacteroides caccae
腐烂别样杆菌 Alistipes putredinis
芬⽒拟杆菌 Bacteroides finegoldii
马赛拟杆菌 Bacteroides massiliensis
卵形拟杆菌 Bacteroides ovatus
粪副拟杆菌 Parabacteroides merdae
产酸拟杆菌 Bacteroides acidifaciens
粪普雷沃⽒菌 Prevotella stercorea
内脏臭⽓杆菌 Odoribacter splanchnicus
埃格尔硫拟杆菌 Bacteroides eggerthii
肠拟杆菌 Bacteroides intestinalis
拟杆菌 Bacteroides coprophilus
产⿊普雷沃⽒菌 Prevotella melaninogenica
约⽒副拟杆菌 Parabacteroides johnsonii
⼆路拟杆菌 Prevotella bivia
芽孢杆菌 Alistipes indistinctus
中间普⽒菌 Prevotella intermedia
变⿊普雷沃⽒菌 Prevotella nigrescens
⽛龈⼆氧化碳嗜纤维菌 Capnocytophaga gingivalis ⼈体拟杆菌 Prevotella corporis
⼝普雷沃⽒菌 Prevotella oris
齿龈拟杆菌 Prevotella oulorum
⽛龈卟啉单胞菌 Porphyromonas gingivalis
栖⽛拟杆菌 Prevotella denticola
短稳杆菌 Empedobacter brevis
纤维素类杆菌 Bacteroides cellulosilyticus
⽔⽣黄杆菌 Flavobacterium aquatile
谭⽒普雷沃⽒菌 Prevotella tannerae
⼝腔普雷沃⽒菌 Prevotella oralis
黄杆菌属 Flavobacterium sp
栖组织普雷沃⽒菌 Prevotella histicola
02 厚壁菌门
Firmicutes
厚壁菌门(Firmicutes)是⼀最⼤的细菌，多数为⾰兰⽒阳性，表现为球状或者杆状，有细胞壁结构。
注：关于⾰兰⽒阳性菌详见：⾰兰⽒阳性菌的详细分类及
然⽽，⼀些例如菌Megasphaera、Pectinatus、Selenomonas 和 Zymophilus，有⼀个多孔的假外膜，使它们⾰兰⽒染⾊阴性。少数如柔膜菌纲（Mollicutes）（如⽀原体），缺乏细胞壁⽽不能被⾰兰⽒⽅法染⾊，但也和其余的⾰兰⽒阳性菌⼀样缺乏第⼆层细胞膜。
原本包括所有⾰兰⽒阳性菌，但⽬前仅包括低G+C含量的⾰兰⽒阳性菌，⽽⾼G+C含量的则被划⼊放线菌门（Actinobacteria）。
△厚壁菌门的许多成员都是有益菌
乳酸杆菌是⼀种常见于酸奶和其他发酵乳制品中的益⽣菌，属于这⼀门。这些微⽣物产⽣⼄酸盐（另⼀种促进健康的短链脂肪酸）、乳酸盐和抗菌物质，可防⽌病原体⼲扰健康。
乳杆菌⽣产各种发酵产品：
布鲁⽒乳杆菌⽤于制作酸奶，⽽嗜酸乳杆菌在⽣产嗜酸乳杆菌中很重要。其他物种有助于⽣产泡菜、酸菜和青贮饲料。
除了乳酸杆菌外，厚壁菌门的其他有益成员也以产⽣丁酸盐⽽闻名，特别是粪杆菌、真杆菌、罗⽒杆菌。
瘤胃球菌——“第三种肠型”
被称为“第三种肠型”的⾕物爱好者，通常以瘤胃球菌为主，瘤胃球菌是厚壁菌门的成员。
肠型通常可以追溯到长期的饮⾷习惯。瘤胃球菌微⽣物组类型的⼈倾向于摄⼊更多全⾕物中的抗性淀粉和膳⾷纤维。
如果想增加肠道中厚壁菌的数量，那么应该多吃⾼纤维⾷物，如苹果，⼤蒜，⼤麦，燕麦，洋葱等。
△厚壁菌门下也有致病菌
许多厚壁菌门能够形成孢⼦，处于不活动、严重脱⽔和对环境压⼒具有⾼度抵抗⼒的休眠阶段。
注：“endospore”这个名字暗⽰了⼀种孢⼦或种⼦状形式，但它不是真正的孢⼦（即不是后代）。它是⼀种精简的休眠形式，细菌可以将⾃⾝还原成这种形式。这些内⽣孢⼦能够抵抗⼲燥并且可以在极端条件下存活。很多环境中都可到内⽣孢⼦，⼀些著名的病原菌都能产⽣孢⼦。
——表⽪葡萄球菌
表⽪葡萄球菌是从⼈类⽪肤中分离出来的最常见的细菌。它是⾮致病性的，所以没有⼈真正担⼼它。
但是⾦黄⾊葡萄球菌是通常与许多疾病有关，例如疖⼦、丘疹、肺炎、⾻髓炎、脑膜炎和关节炎。

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