分子生物学名词解释
6DNA和RNA的结构
Polynucleotide chain：多核苷酸链。包含磷酸二酯骨架与结合有碱基的核糖的单链DNA。
Nucleoside：核苷。核糖通过1位糖苷键连接到一个碱基上形成。核苷没有磷酸分子。
Nucleotide：核苷酸。一个在1位连接碱基，5位连接一个或多个磷酸的核糖。
Phosphodiester linkage：磷酸二酯键。不断重复，构成多核苷酸链的糖-磷酸骨架。
Purine:嘌呤。Adenine:腺嘌呤。Guanine:鸟嘌呤。Pyrimidine:嘧啶。Cytosine:胞嘧啶。Thymine:胸腺嘧啶。Base flipping：碱基翻出。单个碱基从双螺旋中突出的现象。Tautomeric：互变异构。Denature：变性。温度或pH过高时，DNA双链分开的过程。
Annealing(renature)：复性。变性DNA的互补链重新聚合形成双螺旋结构的过程。
Hybridization：杂交。两条单链核酸形成杂交分子的能力。
Hyperchromicity：增性。DNA变性后，吸光度在260nm处明显增强的现象。
Tm (melting point)：熔点。DNA的吸光度增加到最大值一半时的温度。
Linking number：连环数。要使两条DNA链完全分开时一套链必须穿过另一条链的次数。
Twist number：扭转数。DNA一条链完全缠绕另一条链的次数。
Writhe number：缠绕数。双螺旋DNA的长轴在三维空间里重复地自我交叉的次数。
Topoisomerase：拓扑异构酶。催化DNA产生瞬间的单链或双链的断裂而改变连环数的酶。
Ribozyme：核酶。催化生化反应的RNA酶。
7 染体、染质和核小体
Chromosome：染体。由DNA和与其结合的蛋白质构成。
Chromatin：染质。DNA的一段给定区域及其结合蛋白。
Histone：组蛋白。小的碱性DNA结合蛋白。Non-histone：非组蛋白。丰度较低的DNA结合蛋白。Nucleosome：核小体。DNA和组蛋白形成的结构。
Heterochromatin：异染质Euchromatin：常染质Haploid：单倍体Diploid：二倍体polyploid：多倍体regulatory sequences：监管序列。DNA序列外部的与一个给予启动子调节表达相关的核心启动子。Mitosis：有丝分裂。子代细胞维持与亲本细胞染体数目一致的分裂方式。
Meiosis：减数分裂。子代细胞染体数目为亲本细胞一半的分裂方式。
Linker DNA：连接DNA。每个核小体之间的DNA。
Histone-fold domain：组蛋白折叠域。核心组蛋白中调节组蛋白中间体组装的保守区域。
Nucleosome remodeling complex：核小体重塑复合体。利用ATP水解供能，便于核小体改变位置或与DNA
相互作用的蛋白复合体。
Histone chaperone：组蛋白伴侣。核小体组装工厂中避免组蛋白与DNA发送无效的相互作用的蛋白质。Nucleus：细胞核Nucleolus：核仁interphase：分裂间期
Centromere：着丝粒。指导动粒形成，为DNA复制后染体正确分离所必需。
Kinetochore：动粒。拉动妹染单体互相远离并进入两个子代细胞的蛋白质复合体。
Telomere：端粒。一种线性染体末端。这些序列保护染体免于降解，作为复制专门的起源。
8DNA的复制
Primer-template junction：引物-模板接头。具有一定特定排列的双链或单链DNA。
DNA polymerase：DNA聚合酶。催化DNA合成的酶。
Processivity：延伸能力。每次酶与引物-模板接头结合时所添加核苷酸的平均数。
Semiconservative Replication：半保留复制。
Replication fork：复制叉。刚分开的模板链与未复制的双链DNA之间的连接区。
Leading strand：前导链。与复制叉移动方向相同的新合成的DNA链。
Lagging strand：后随链。与复制叉移动方向相反的新合成的DNA链。
Replication eyes：复制眼。DNA复制区域两端包含一段很长的未复制区域的结构。
Okazaki fragment：冈崎片段。后随链上形成的短的新链DNA片段。
Unidirectional replication：单向复制Bidirectional replication：双向复制
Primase：引物酶。能在单链DNA模板上制造短的RNA引物的特殊RNA聚合酶。
Cooperative binding：协同结合。一个SSB的结合会促进另一个SSB与其相邻的单链DNA结合的现象。DNA Pol III holoenzyme: DNA聚合酶III全酶。负责大肠杆菌基因复制的具有高度延伸能力的蛋白质复合体。Polymerase switching：聚合酶的切换。真核生物DNA聚合酶δ或聚合酶ε取代聚合酶α的过程。
Sliding clamp loader：滑动夹装载器。催化滑动夹打开并将其安放在DNA上的特殊的蛋白质复合体。Replisome：复制体。复制叉上全部的作用蛋白的总和。
Origin of replication：复制起始位点。DNA解旋和复制起始发生的特殊位点。
Replicon：复制子。基因复制开始的特定起始位点。
Replicator：复制器。足够指导DNA复制起始的整套顺式作用的DNA序列。cooperative
Initiator protein：起始子蛋白。特异性识别复制器中的一个DNA元件并激活复制起始的蛋白质。
Origin recognition complex（ORC）：起始位点识别复合体。真核细胞的起始子，是一种与复制子结合并将其
他复制蛋白召集到复制器上的六蛋白复合体。
End replication problem：末端复制问题。后随链的合成不能复制线性染体的最末端的现象。
Sliding DNA clamp：滑动DNA夹。Licensing factor：执照因子。
9DNA的可突变性和修复
Transition：转换。嘌呤到嘌呤或嘧啶到嘧啶的替换。Transversion：颠换。嘌呤到嘧啶或嘧啶到嘌呤的替换。Point mutation：点突变。改变单个核苷酸的突变。
DNA microsatellites：微卫星DNA。易突变序列，是2、3或4核苷酸序列的重复。
Mismatch repair system：错配修复系统。检验碱基配对并进行修复的系统。
Dam methylase：dam甲基化酶。使DNA两条链上5’-GTAC-3’的A都甲基化的酶。
Mutagen：诱变剂。Alkylation：烷基化oxidation：氧化radiation：辐射
Base analog：碱基类似物。能替换正常碱基的化合物。
Intercalating agent：嵌入剂。能插入碱基间的化合物。
Excision repair system：剪切修复系统。指导受损的核苷酸从DNA上被除去而未被修复的
系统。
Base excision repair：碱基切除修复。Nucleotide excision repair：核苷酸切除修复。Recombinational repair：重组修复。当两条DNA链都受损时采用的修复方式。
Photoreactivation：光活化作用。直接逆转紫外辐射造成的嘧啶二聚体结构。
Glycosylate：糖基化酶。识别并通过水解糖苷键除去受损碱基的酶。
Transcription-coupled repair：转录耦联修复。当RNA聚合酶转录过程中被模板链的损伤终止时，核苷酸切
除修复可拯救RNA聚合酶的现象。
Translesion synthesis：移损合成。绕过受损部位继续复制的方式。
10 分子水平上的同源重组
homologous recombination：同源重组。指两个有相似或者相同序列的DNA分子交换遗传信息的过程。Double-strand break (DSB) repair model：双链断裂修复模型。

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