atb计算分子
ATB计算分子是一种通过计算机程序进行分子模拟的方法。在ATB网站生成itp文件之前，需要注册一个ATB账号，然后。具体操作步骤如下：
1. 创建目标分子的结构文件，保存为pdb结构。
2. 点击网页左上角的Submit，出现下面的页面：
    - Molecule type：根据分子所属归类选择，不清楚话就用默认的。
    - Net charge (e)：根据分子对外所带的电荷是多少，填入即可。
    然后点击Upload PDB file，把创建好的PDB文件上传。
3. 上传完成后点击Next。
pdb文件阅读器安卓4. 若有多个已存在的分子，选择一个RMSD最小的，然后点击Add to Saved Molecule。
5. 提交完分子之后，ATB网站会进行优化，并发送邮件提示。根据分子的大小，计算可能需
要几天时间，需要耐心等待。
6. 计算完成后，点击账户下拉菜单中的Saved Molecules。
7. 到上传的分子，然后点击其前面的编号。
8. 进入之后，点击Molecular Dynamics（MD）Files。
9. 网站会提供全原子力场和联合原子力场的itp和pdb文件，根据需要自行打开，然后保存。务必保证itp和pdb文件对应一致。
10. 把itp和pdb文件都保存下来之后，把itp文件include到总的top文件里面即可。
请注意，ATB计算分子的操作可能因为版本更新而有所不同，建议你在使用前仔细阅读相关的说明和指导，以确保计算的准确性和可靠性。

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