Geant4及GATE安装过程记录
1. ⾸先安装linux系统，双系统、虚拟机都可以。
2.安装Geant4.可以按照来安装Geant4。
准备⼯作
Geant4跟ROOT有很多共同的依赖，所以可以⾸先安装⼀下ROOT所需的依赖，⾥⾯有好多是ROOT需要但是Geant4并不需要的， 如果你有精⼒可以⼀个⼀个挑出来，这⾥直接全部安装． (可以访问来查看ROOT的依赖包.)
如果你的linux发⾏版是 Fedora 18, 19 and 20; Scientific Linux 5, 6; CentOS 6, 7 : ($符号是终端命令提⽰符，不要把这个符号复制到终端)
$ sudo yum install git cmake gcc-c++ gcc binutils  libX11-devel \
libXpm-devel libXft-devel libXext-devel gcc-gfortran openssl-devel pcre-devel \
mesa-libGL-devel mesa-libGLU-devel glew-devel ftgl-devel mysql-devel \
fftw-devel cfitsio-devel graphviz-devel \
avahi-compat-libdns_sd-devel libldap-dev python-devel \
libxml2-devel gsl-static
如果你的linux发⾏版是 Ubuntu 10, 12 , 14 and 16:
$ sudo apt-get install git dpkg-dev cmake g++ gcc binutils libx11-dev libxpm-dev \
libxft-dev libxext-dev
gfortran libssl-dev libpcre3-dev \
xlibmesa-glu-dev libglew1.5-dev libftgl-dev \
libmysqlclient-dev libfftw3-dev libcfitsio-dev \
graphviz-dev libavahi-compat-libdnssd-dev \
libldap2-dev python-dev libxml2-dev libkrb5-dev \
libgsl0-dev libqt4-dev
其他发⾏版可以⾃⼰看⼀下上⾯提供的⽹址，这⾥不再重复． 除此之外还需要安装cmake，以及X11，需要说明的是10.1.2以后的版本cmake需要3.3版本以上，所以你可以先在终端输⼊ cmake --version看⼀下cmake版本，如果版本太低的话需要⼿动安装⼀个⾼版本的cmake. X11跟图形显⽰有关系:
$ sudo apt-get install cmake libx11-dev libxext-dev libxtst-dev libxrender-dev libxmu-dev  libxmuu-dev #安装需要的⼯具
$ sudo apt-get install qt4
下载主程序
Geant4需要下载主程序以及数据包，并且数据包要与主程序的版本对应． 下载Geant4的地址，下载 Source files 中那个GNU or Linux tar format即可， 没错，就是只有三⼗⼏M，我第⼀次安装的时候还以为下载错了．．．下载之后解压到某⽬录，为了⽅便，我们直接放在⽤户home⽬录下，下载后解压． 并且创建名为geant4-build的⽂件夹.上⾯这段可以⽤下⾯这段代码实现:
$ wget h/geant4/support/source/geant4.10.03. -O  $HOME/geant4.
10.03. #下载源程序
$ cd $HOME
$ tar xvzf geant4.10.03.
下载data⽂件
data⽂件是geant4运⾏所需要的各种数据⽂件，⽤户可以在编译的时候⽤参数指定下载，但是速度可能会很慢，建议直接⽤浏览器下载好拷贝过去． 下载地址仍然是上⾯下载主程序的地址，如果不清楚以后会⽤到哪些数据⽂件， 可以把所有数据⽂件都下载，点击Data files下载所有数据⽂件并解压，新建⼀个名为data的⽂件夹并把之后把所有解压后的数据⽂件移动到data⽂件夹.
使⽤cmake安装
原理是⾸先创建⼀个geant4-build⽂件夹，然后进⼊geant4-build⽂件夹后使⽤cmake指定⼀些参数，最后make安装. 注意：如果先要qt界⾯，确保你的计算机内安装好了qt，懒得⼀个⼀个装可以直接:
$ sudo apt-get install qt4*
下⾯为安装geant4过程:
$ mkidr geant4-build && cd geant4-build
$ cmake  -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/geant4-install/  -DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON
\ -DGEANT4_USE_RAYTRACER_X11=ON -DGEANT4_USE_QT=ON
\ -DGEANT4_USE_SYSTEM_EXPAT=OFF
\ GEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON $HOME/geant4.10.03.p01
$ make -j8
$ make install -j8
其中： -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/geant4-install/ 参数表⽰安装的位置
-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON -DGEANT4_USE_RAYTRACER_X11=ON 表⽰开启图形可视化
-DGEANT4_USE_QT=ON 表⽰开启Qt（不需要Qt界⾯的可以不加此参数）
GEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON 为开启多线程
$HOME/geant4.10.03.p01 表⽰源程序，如果下载的不同版本记得更改为解压后的⽂件夹名字.
make -j8 or make install -j8中的-j8表⽰⼋个线程运⾏．如果计算机有更多核⼼可⽤-j16或更多． cmake结束后，如果没有提⽰错误，终端出现类似如下:
--Configuring done
--Generating done
--Build files have been written to: /home/xxx
则表⽰成功
运⾏及栗⼦
perl下载安装教程1）以上过程结束后，会在home⽬录下看到geant4.10.03.p01，geant4-build,geant4-install三个⽂件夹，把之前准备好的data⽂件夹移动到geant4.9-install/share/Geant4-10.03下 （可以看到此⽂件夹下有名为geant4make的⽂件夹）。
2）进到刚才提到的geant4make⽂件夹，会看到名为geant4make.sh的⽂件。 终端切换到⽬录并执⾏：
$ source geant4make.sh
每次使⽤geant4都必须运⾏此环境变量，不想每次都运⾏可以把该命令写到.bashrc中．
$ echo 'source $HOME/geant4-install/share/Geant4-10.03.p01/geant4make/geant4make.sh' >> $HOME/.bashrc
或者
echo 'source geant4的安装根⽬录/bin/geant4.sh' >> ~/.bashrc
3)运⾏栗⼦ 上⾯前两步执⾏成功后，可以切换到栗⼦⽬录，具体可以在源程序⽂件夹下到，⾥⾯有个examples⽂件夹.
$ cd $HOME/geant4.10.03.p01/examples/basic/B1
$ make -j8
看到类似:
LinkingexampleB1
...Done!
表⽰编译成功 然后终端输⼊命令：
$ exampleB1
运⾏最简单的栗⼦．
若上述编译⽅法不成功，可以使⽤如下⽅法进⾏编译：
1）⾸先还是进⼊到例⼦所在的⽬录下，打开终端；
2）运⾏下⾯的代码
mkdir build #新建⼀个⽬录，⽤于存放编译之后的⽂件
cd build
cmake .. #..表⽰上⼀级⽬录
make -j8 #使⽤8线程进⾏编译
3）未报错的话，就会在build⽬录下得到⼀个exampleB1，可执⾏⽂件，然后打开终端，运⾏其即可。正确的话，会出现如下界⾯。
3.安装ROOT，可以按照来进⾏安装。
4.安装ITK，可以按照来进⾏安装。此⽅法会将ITK安装到 /usr/local/lib/cmake/ITK-version 中。
⾸先，从下⾯地址下载ITK安装包。
/ITK/resources/software.html
然后解压到需要安装的路径。
tar -xzf ar.gz
再在解压出来的路径下⾯新建⼀个bin⽂件夹，并进⼊bin。
mkdir bin
cd bin
然后运⾏下⾯这句，其中.. 表⽰上⼀级路径
ccmake -DITK_USE_REVIEW=ON ..
在之后出来的gui当中，配置下⾯这些设置，如果没有出现下⾯这些选项，则先按c，之后就会出现。
BUILD_EXAMPLES                  OFF
BUILD_TESTING                    OFF
ITKV3_COMPATIBILITY              OFF
ITK_BUILD_DEFAULT_MODULES        ON
ITK_WRAP_PYTHON                  OFF
配置完成之后，知道gui⾥⾯出现 g ，然后按 g 进⾏⽣成。
再运⾏下⾯这两句进⾏安装
make -jN (N is the number of processor(s) in your PC)
sudo make install
5.安装GATE
可以按照来进⾏安装。
⾸先下载安装包
/GATE80
然后，解压到安装路径
tar -xzf gate_v8.
然后，在刚才的同级路径下，创建build和install两个⽂件夹
mkdir gate_v8.0-build
mkdir gate_v8.0-install
进⼊build⽂件夹，运⾏
ccmake ../gate_v8.0
之后在出来的GUi中，按照下图进⾏配置
然后按c进⾏配置，当GUI中出现g时，按g进⾏⽣成。
然后运⾏
make -jN (N is the number of processor(s) in your PC)
make install
进⾏安装。可能在安装过程中会出现错误，可以看安装记录中是什么错误，如果是某个⽂件没有下载下来，则可以将刚才配置⽣成的⽂件全部删除，然后重新配置，重新配置时，将 GATE_DOWNLOAD_BENCHMARKS_DATA设置为OFF，则不会报错，但是后⾯就不能⽤benchmark test了。
之后，打开 .bashrc，在末尾添加上，注意修改⾃⼰的路径。
export PATH=$PATH:/PATH_TO/gate_v8.0-install/bin
保存，关闭之后，⽤下⾯这句更新
source .bashrc
最后，打开终端，运⾏下⾯这句，没有报错的话，则GATE安装成功。

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