福利常用商业化载体的图谱解析(Ⅱ)—详解
1  载体必需元件
复制起始位点(Ori)+ 筛选标签(抗性基因等)
minimal
Minimal Plasmid Made by Synbio Center: pSC0331A
目前几乎所有的商业化质粒载体的克隆系统都是E.coli(大肠杆菌),因为在丰富培养基中E.coli生长非常快,20 min内就可以复制一代,所以我们通常是在E.coli中完成载体系统的构建和质粒制备,而在目标菌株或其他类型细胞中完成所需基因的表达和其他基因操作,也正因为这个原因,几乎所有的商业化质粒载体都有一套E.coli的复制起始位点和筛选元件。
2  载体元件
2.1  Ori(复制起始位点)
任何商业化载体的复制起始位点类别对于质粒构建与克隆都是个非常重要的信息,因为该信息决定了载体的质粒拷贝数(当然也有EPI400这种可以限制质粒拷贝数的特殊菌株),为了载体制备的方便性,绝大多数的表达载体都是高拷贝的,如常用的pcDNA家族载体,而pET家族载体是低拷贝的,因为载体上的Rop蛋白可以让该系列载体维持在低拷贝水平。常用的克隆载体的Ori类别如下列表所示:
非常值得一提的是,在人类基因组测序计划的时代所开发出来的BAC(细菌人工染体)系统载体,在构建长片段DNA和小规模基因组时有着巨大的优势,因为其单拷贝特征使得质粒的复制对细胞的代谢系统产生的影响是最小的,所以在构建很多对细胞有毒性的基因和基因组时会取得成功,而常规的高拷贝载体很多时候会无法得到正确构建(往往会得到有很多突变或者缺失的构建),甚至是使得克隆宿主菌无法正常生长出单克隆菌落。
2.2  Selection Marker
常用的筛选标记有抗性筛选、ccdB和SacB负筛选、营养缺陷型筛选等等,部分列表如下:
2.3  Ori+筛选标记载体元件的载体举例
2.4  载体元件—RBS
No!No!No!这里的RBS 是指 Ribosome Binding Site 原核生物,如大肠杆菌的RBS。

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