⼀分钟实现差异分析柱形图“⼤变⾝”
差异分析是基础数据分析⼿段，在进⾏样本间差异⽐较的时候经常被⽤到。所以⽆论是中⽂核⼼期刊还是SCI论⽂，常常需要绘制差异分析柱形图。
显著性标记柱形图是在差异分析柱形图的基础上添加显著性标识，可以直观的呈现不同样本间的差异关系和差异显著性。在不同品种的表型差异分析或样本间基因表达量统计中均被经常使⽤。
图形由柱形图、误差线和显著性标识三部分组成。柱形图表⽰样本的表型或表达量数值；误差线代表每个样本存在的潜在误差；显著性标识代表样本间差异的显著程度（图1）。
图1 差异分析柱形图
在⽇常的实验中，我们会获得⼤量样本的表型或表达量数据，如果⽤Excel⼀个⼀个进⾏t检验然后P上显著性标识，既繁琐⼜耗时，并且还有可能⼀次性需要输出多张图，如果不会使⽤R语⾔就很难操作了。⼀想到进⾏⼀个差异分析都这么⿇烦，还不得不做，就感觉头秃。
不过没关系，Omicshare Tools可以帮你“⼀分钟”实现差异分析并在柱形图上添加显著线。⼀起来看⼀下如何操作吧。操作步骤
怎么大批量数据核对差异1
进⼊⼯具
图2 显著性标记柱形图⼯具图标
差异分析⼯具分为两种，两组数据之间差异分析进⼊“显著性标记柱形图（两组）”；多组数据间两两进⾏差异分析进
⼊“显著性标记柱形图（多组）”。
⼯具地址：
复制前往以上链接或点击阅读原⽂，登录Omicshare云平台→“我的软件”→搜索“显著性标记柱形图”
2
输⼊⽂件
点击图标进⼊后跳转⾄操作界⾯。界⾯包含“数据输⼊”与“调整参数”两部分，其中需要输⼊的两个⽂件为txt格式，可以⽤excel表另存为txt格式。
图3 输⼊⽂件页⾯
输⼊两组数据：
输⼊的表格为差异检验表，第⼀列是不同样本的名称，之后每⼀⾏为该样本每个重复的数据，输⼊的样本为两组。但是要注意的是，每次⾄少要输⼊三次重复。
A288.93276.81527.85……
A288.93276.81527.85……
B924.31746.8651.47……
图4 输⼊两组数据的表格
输⼊多组数据：
与输⼊两组数据的格式相同，不同的是每次输⼊的多组样本。
A288.93276.
B924.31746.
C321.4351.
图5 输⼊多组数据的表格
3
参数调整
通过参数调整可以对输出图形做简单修改：
统计检验⽅法选择：可以选择T检验或wilcoxon秩和检验。
输⼊图⽚的标题。
输⼊x轴和y轴的标题。
需要注意的是，每个标题必须是英⽂，要不然⽆法显⽰。
图6 作图相关参数
4
输出结果
在Omicshare云平台提交任务后会输出结果压缩包，包含结果表格与柱形图两个部分内容。结果表格
表头从左到右表⽰⽐较组、P值、显著性和分析⽅法。*代表显著性，ns代表组间⽆差异。comparep.formatp.signifmethod
A-vs-B0.023*T-test
图7 两组差异分析结果表格
comparep.formatp.signifmethod
A-vs-B0.023*T-test
A-vs-C0.722ns T-test
B-vs-C0.025*T-test
图8 多组差异分析结果表格
输出图形
图9 显著性标识柱形图（两组）
图10 显著性标识柱形图（多组）
图形解读：横坐标为两个⽐较组名称，纵坐标为⽐较组数据的平均值。*代表显著性，*代表p值⼩于0.05.**代表p值⼩于0.01，***代表p值⼩于0.001，以此类推。
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参考⽂献
[1] Ting Z , Pengbo X , Wenxiu W , et al. Arabidopsis G-Protein βSubunit AGB1 Interacts with BES1 to Regulate Brassinosteroid Signaling and CellElongation[J]. Frontiers in Plant Science, 2018, 8:2225.
[2] 代资举, 王新涛, 杨青, et al. ⽟⽶雄穗分枝数主效QTL定位及qTBN5近等基因系构建[J]. 作物学报, 2018,v.44(08):27-35.
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