Linux安装运⾏Fastqc
1.从官⽹下载FastQC
2.解压⽂件,并进⼊该⽂件
将其⾄于某个⽂件夹,unzip fastqc_v0.11.5.zip.
3.进⼊解压⽬录,设置可执⾏权限
chmod u+x fastqc #chmod 754 fastqc
4.配置环境变量
vim ~/.bashrc
export PATH=$PATH:/home/zhou/bio_solfware/FastQC/ # 添加⾄⽂件最后⼀⾏,注意这个是整个⽂件夹source ~/.bashrc #使配置⽂件⽣效
5. 下载Java
5.1 下载Java, sudo apt install openjdk-8-jdk
5.2 查看Java是否安装成功 Java -version.
6. 常见Fastqc命名
fastqc -t 8 x.fastq -o ./test
linux安装jdk环境变量
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