人民医院基因扩增实验室丙型肝炎病毒核酸检测标准操作程序
1 项目名称
丙型肝炎病毒核酸检测
2 检验方法名称
TaqMan荧光定性检测
3 方法学原理
对丙肝病毒进行逆转录反应生成cDNA,PCR扩增时加入一对丙型肝炎病毒cDNA特异性引物,同时加入一个特异性的、能与PCR产物杂交的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个荧光报告基团(R)和一个荧光淬灭基团(Q)。探针完整时,R基团发射的荧光信号被Q基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使R荧光基团和Q荧光基团分离,Q基团对R基团的抑制吸收作用消失,荧光监测系统就可接收到R基团的荧光信号。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成。被切割产生的荧光分子数与PCR产物的数量成比
例,这样就实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。
4 标本要求
4.1 血清:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入无抗凝剂普通试管,待凝固后1500r/min离心5分钟,吸取上层血清,转移至1.5ml灭菌离心管;
4.2 血浆:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入EDTA或枸橼酸钠抗凝剂的试管,轻轻颠倒混匀5~10次,使抗凝剂与静脉充分混匀,5~10分钟后即可分离出血浆,转移至1.5ml灭菌离心管;
4.3 标本保存:分离后的血清或血浆在2~8℃条件下保持不应超过72小时;-20℃可保存1个月;要长期保存的,需分装后储存于-70℃。
5 试剂
5.1 试剂名称:丙型肝炎病毒核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)
5.2 生产厂家:XXXXXXX
5.3 试剂货号:#DA-B070;
5.4 包装规格:10人份/盒;
5.5 试剂成份:
组成部分 | 数量 | 主要组成成份 |
RNA提取液A(100µl/管) | 1管 | 二氧化硅、DEPC水(pH2.0) |
RNA提取液B(4000µl/管) | 1管 | GuSCN、Tris-HCl(pH6.4)、EDTA(pH8.0)、Triton-100 |
HCV PCR反应液Ⅰ(180µl/管) | 1管 | 引物、dNTPs、5×逆转录缓冲液 |
逆转录酶系(20µl/管) | 1管 | mMLV逆转录酶、RNasin |
HCV PCR反应液(400µl/管) | 1管 | 上下游引物、荧光探针、dNTPs、5×PCR反应缓冲液、双蒸水 |
Taq酶(30µl/管) | 1管 | Taq酶原液、Tris-HCl(pH8.0)、KCl、EDTA(pH8.0)、DTT、丙三醇 |
DEPC H2O(200µl/管) | 1管 | DEPC H2O |
阴性质控品(250µl/管) | 1管 | HCV阴性血清 |
HCV临界阳性质控品(200µl/管) | 1管 | HCV强阳性血浆(2×107IU/ml)稀释1600倍制成 |
HCV强阳性质控品(200µl/管) | 1管 | HCV强阳性血浆(2×107IU/ml)稀释16倍制成 |
HCV阳性定量参考品(1.0×105IU/ml)10µl/管 红 | 1管 | 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×105IU/ml) |
HCV阳性定量参考品(1.0×106IU/ml)10µl/管 黄 | 1管 | 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×106IU/ml) |
HCV阳性定量参考品(1.0×107IU/ml)10µl/管 蓝 | 1管 | 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×107IU/ml) |
HCV阳性定量参考品(1.0×108IU/ml)10µl/管 绿 | 1管 | 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×108IU/ml) |
5.6 试剂储存条件:保存于—20℃,有效期6个月。
6 仪器
ABI 7500全自动基因扩增检测仪
7 操作步骤
7.1 RNA提取
7.1.1 阴性质控品处理
7.1.1.1 取出阴性质控品,8000rpm离心数秒;
7.1.1.2 取灭菌的0.5ml离心管加入10µlRNA提取液A(充分混匀后吸取),加入100µl阴性质控品,再加入200µlRNA提取液B,振荡混匀,室温放置5分钟,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;
7.1.1.3 加200µlRNA提取液B,充分混匀(用移液器吹打),000rpm离心1分钟,小心吸去上清;
7.1.1.4 加预冷的75%乙醇400µl,充分混匀,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;
7.1.1.5 加预冷的75%乙醇400µl,充分混匀,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;
7.1.1.6 打开管盖,65℃干燥10分钟,盖上管盖待用于逆转录。
7.1.2 标本处理(血清和血浆标本处理相同)
7.1.2.1 取灭菌的1.5ml离心管加入10µl RNA提取液A(充分混匀后吸取),加100µl血清,再加入200µl RNA提取液B,振荡混匀,室温放置5分钟,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;
7.1.2.2 一下步骤同“阴性质控品处理”的7.1.1.3~7.1.1.6.
7.1.3 HCV临界阳性质控品处理(同阴性质控品);
7.1.4 HCV强阳性质控品处理(同阴性质控品);
7.1.5 HCV阳性定量参考品处理:8000rpm离心数秒,备用;
7.2 逆转录
7.2.1 向干燥后的沉淀管加入18µl PCR反应液Ⅰ打匀,再加逆转录酶系2µl,振荡混匀;
7.2.2 37℃放置45分钟,95℃加热3分钟。8000rpm离心1分钟,待用。核酸检测结果阳性参考值阴性
7.3 PCR扩增
7.3.1 试剂准备(在试剂准备区操作):按比例(HCV PCR反应液40µl/人份+ Taq酶3µl/人份)取相应量的PCR反应液及Taq酶,充分混匀后按43µl/管分装至0.2ml离心管中备用。
7.3.2 加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入逆转录后的样品(包括样本、阴性质控品、临界阳性质控品和强阳性质控品)上清液5µl,或直接加入阳性定量参考品5µl,8000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。
7.3.3 设置PCR循环扩增程序如下
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