使⽤matlab代码读取展⽰MIT-BIH⼼律失常数据库数据(带注释)
%*读取MIT-BIH ⼼律失常数据库
%------ SPECIFY DATA ------------------------------------------------------
%------ 指定数据⽂件 -------------------------------------------------------
PATH= ‘C:\Users\lenovo\Desktop\MITBIH\104’; % 指定数据的储存路径
HEADERFILE= ‘104.hea’; % .hea 格式,头⽂件,可⽤记事本打开
ATRFILE= ‘104.atr’; % .atr 格式,属性⽂件,数据格式为⼆进制数
DATAFILE=‘104.dat’; % .dat 格式,ECG 数据
SAMPLES2READ=3600; % 指定需要读⼊的样本数
% 若.dat⽂件中存储有两个通道的信号:
% 则读⼊ 2*SAMPLES2READ 个数据
%------ LOAD HEADER DATA --------------------------------------------------
%------ 读⼊头⽂件数据 -----------------------------------------------------
%
% ⽰例:⽤记事本打开的117.hea ⽂件的数据
%
% 117 2 360 650000
% 117.dat 212 200 11 1024 839 31170 0 MLII
% 117.dat 212 200 11 1024 930 28083 0 V2
% # 69 M 950 654 x2
% # None
%
%-------------------------------------------------------------------------
fprintf(1,’\n$> WORKING ON %s …\n’, HEADERFILE); % 在Matlab命令⾏窗⼝提⽰当前⼯作状态
%
% 【注】函数 fprintf 的功能将格式化的数据写⼊到指定⽂件中。
% 表达式:count = fprintf(fid,format,A,…)
% 在字符串’format’的控制下,将矩阵A的实数数据进⾏格式化,并写⼊到⽂件对象fid中。该函数返回所写⼊数据的字节数 count。% fid 是通过函数 fopen 获得的整型⽂件标识符。fid=1,表⽰标准输出(即输出到屏幕显⽰);fid=2,表⽰标准偏差。
%
signalh= fullfile(PATH, HEADERFILE); % 通过函数 fullfile 获得头⽂件的完整路径
fid1=fopen(signalh,‘r’); % 打开头⽂件,其标识符为 fid1 ,属性为’r’–“只读”
z= fgetl(fid1); % 读取头⽂件的第⼀⾏数据,字符串格式
A= sscanf(z, ‘%*s %d %d %d’,[1,3]); % 按照格式 ‘%*s %d %d %d’ 转换数据并存⼊矩阵 A 中
nosig= A(1); % 信号通道数⽬
sfreq=A(2); % 数据采样频率
clear A; % 清空矩阵 A ,准备获取下⼀⾏数据
for k=1:nosig % 读取每个通道信号的数据信息
z= fgetl(fid1);
A= sscanf(z, ‘%*s %d %d %d %d %d’,[1,5]);
dformat(k)= A(1); % 信号格式; 这⾥只允许为 212 格式
gain(k)= A(2); % 每 mV 包含的整数个数
bitres(k)= A(3); % 采样精度(位分辨率)
zerovalue(k)= A(4); % ECG 信号零点相应的整数值
firstvalue(k)= A(5); % 信号的第⼀个整数值 (⽤于偏差测试)
end;
fclose(fid1);
clear A;
%------ 读取 ECG 信号⼆值数据 ----------------------------------------------
%
if dformat~= [212,212], error(‘this script does not apply binary formats different to 212.’); end; signald= fullfile(PATH, DATAFILE); % 读⼊ 212 格式的 ECG 信号数据
fid2=fopen(signald,‘r’);
A= fread(fid2, [3, SAMPLES2READ], ‘uint8’)’; % matrix with 3 rows, each 8 bits long, = 212bit fclose(fid2);
% 通过⼀系列的移位(bitshift)、位与(bitand)运算,将信号由⼆值数据转换为⼗进制数
M2H= bitshift(A(:,2), -4); %字节向右移四位,即取字节的⾼四位
M1H= bitand(A(:,2), 15); %取字节的低四位
PRL=bitshift(bitand(A(:,2),8),9); % sign-bit 取出字节低四位中最⾼位,向右移九位
PRR=bitshift(bitand(A(:,2),128),5); % sign-bit 取出字节⾼四位中最⾼位,向右移五位
M( : , 1)= bitshift(M1H,8)+ A(:,1)-PRL;
M( : , 2)= bitshift(M2H,8)+ A(:,3)-PRR;
if M(1,:) ~= firstvalue, error(‘inconsistency in the first bit values’); end;
switch nosig
case 2
M( : , 1)= (M( : , 1)- zerovalue(1))/gain(1);
M( : , 2)= (M( : , 2)- zerovalue(2))/gain(2);
TIME=(0:(SAMPLES2READ-1))/sfreq;
case 1
M( : , 1)= (M( : , 1)- zerovalue(1));
M( : , 2)= (M( : , 2)- zerovalue(1));
M=M’;
M(1)=[];
sM=size(M);
sM=sM(2)+1;
M(sM)=0;
M=M’;
M=M/gain(1);
TIME=(0:2(SAMPLES2READ)-1)/sfreq;
otherwise % this case did not appear up to now!
% here M has to be sorted
disp(‘Sorting algorithm for more than 2 signals not programmed yet!’);
end;
clear A M1H M2H PRR PRL;
fprintf(1,’\n$> LOADING DATA FINISHED \n’);
atrd= fullfile(PATH, ATRFILE); % attribute file with annotation data fid3=fopen(atrd,‘r’);
A= fread(fid3, [2, inf], ‘uint8’)’;
fclose(fid3);
ATRTIME=[];
ANNOT=[];
sa=size(A);
saa=sa(1);
i=1;
while i<=saa
annoth=bitshift(A(i,2),-2);
if annoth59
ANNOT=[ANNOT;bitshift(A(i+3,2),-2)];
ATRTIME=[ATRTIME;A(i+2,1)+bitshift(A(i+2,2),8)+…
bitshift(A(i+1,1),16)+bitshift(A(i+1,2),24)];
i=i+3;
elseif annoth60
% nothing to do!
elseif annoth61
% nothing to do!
elseif annoth62
% nothing to do!
elseif annoth==63
hilfe=bitshift(bitand(A(i,2),3),8)+A(i,1);
hilfe=hilfe+mod(hilfe,2);
i=i+hilfe/2;
else
ATRTIME=[ATRTIME;bitshift(bitand(A(i,2),3),8)+A(i,1)];
ANNOT=[ANNOT;bitshift(A(i,2),-2)];
end;
i=i+1;
end;
ANNOT(length(ANNOT))=[]; % last line = EOF (=0)
fprintf格式ATRTIME(length(ATRTIME))=[]; % last line = EOF
clear A;
ATRTIME= (cumsum(ATRTIME))/sfreq;
ind= find(ATRTIME <= TIME(end));
ATRTIMED= ATRTIME(ind);
ANNOT=round(ANNOT);
ANNOTD= ANNOT(ind);
%------ DISPLAY DATA ------------------------------------------------------
figure(1); %clf, box on, hold on
plot(TIME, M(:,1),‘b’);
plot(M(:,1),‘r’);
if nosig==2
plot(TIME, M(:,2),‘b’);
end;
for k=1:length(ATRTIMED)
text(ATRTIMED(k),0,num2str(ANNOTD(k)));
end
xlim([TIME(1), TIME(end)]);
xlabel(‘Time / s’); ylabel(’ MLII导联 / mV’);
string=[‘MIT⼼律失常ECG原始signal ‘,DATAFILE];
title(string);
fprintf(1,’\nKaTeX parse error: Undefined control sequence: \n at position 28: … DATA FINISHED \n'); fprintf(1,'…> ALL FINISHED \n’);
ecg1=M(:,1);⼤家基本都使⽤的这⼀列数据,进⾏实验,因为这组数据波形⽐较好⼀些。
其中,ATRTIMED为标注R的时间(单位s),ANNOTD为ATRTIMED处的标记。
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