NCBI数据库Fastq原始序列上传和登录号获取
最近⽂章要求原始数据上传NCBI数据库，⼩⽩摸索了⼀路总算有了点认识哈哈~写下来当做笔记。
1.账号
⾸先我们要登录NCBI⽹站，见图1右上⾓，如果有账号直接登陆就好。没有的话需要注册，最近NCBI⽹站不能注册只能通过第三⽅账号注册登录，⽐如google，facebook等(图三)。facebook注册了⼀半想起来我有个现成的google邮箱，但是申请的时候打错字了，所以注销了google 重新开了⼀个。另外就是google邮箱申请需要外⽹，我朋友推荐了蓝灯(lantern)，之前⽤过觉得⽹速不好，最近下载了⽤，感觉申请账号看邮箱，妥妥的。此外遇到的google邮箱申请的时候，电话号码显⽰不能注册，第⼀点是要加86区号，另外就是浏览器语⾔设置成英⽂。⽹上有教程，⼤家遇到可以查查。
图1
gzip是什么文件夹图2
图3
2.Bio pro jec t申请
pr o
这部分和⽹上⼤多数的教程就差不多了，记录的不详细的部分⼤家可以在搜⼀搜。进⼊submit，然后到my submissions，之后进⼊BioProject，点击new submission。这部分的步骤有很多种，并不固定如何进⼊建⽴账号的顺序等等，⽅法很多，⽹上教程，跟着⼀步⼀步来就可以。
图4
图5
图6
图7
提交者信息的填写，这部分没什么好说的，根据实际情况来吧。下⼀步是项⽬类型，还是根据实际情况来，没啥好说的。之后有物种等等信息填写，繁琐到我不想解释哈哈。送你们两条连接吧~这两个连接给的很详细，所以不想解释了。我写点别的了。BioSample内容填写也差不多。参照这两个链接就好。
⼿把⼿教你NCBI数据上传
【实⽤⼲货】如何上传数据⾄NCBI？
图8
图9
图10
3.数据上传部分
建⽴SRA，第⼀页的Submitter完全相同，后边是和Biosample，Bioproject建⽴连接。图12是样本基本
信息填写，和bioproject，biosample 相同可以⼀条⼀条的添加，也可以直接传表，把表格下下来，然后填写，每个列名都有批注，我记得好像表格三个⼯作簿还是每个选项的解释。
图11
图12
上传数据，数据量少的话选择第⼀种，多的话后边两种，我选的第⼆种。通过miniconda下载安装了Aspera。conda安装真的简单，也就两三句命令吧~
source activate 进⼊conda
conda info -e 查看环境
conda create -n Aspera创建新环境
conda activate Aspera 进⼊Aspera环境
conda install -c hcc aspera-cli -y Aspera环境的安装
ascp -h 查看是否安装成功
另外就是注意key file位置：miniconda3/envs/Aspera/etc/asperaweb_id_dsa.openssh。对应⾃⼰⽂件的存放位置去就是了。

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