微⽣信在线绘制KEGGPathway通路分类汇总图
KEGG Pathway分析是⽂献中⼏乎必备的⼀项功能分析。在pathway富集分析中，我们⼀般关注的是输⼊基因富集到哪些通路，但是殊不知，这些通路还可以进⾏分类汇总。
在KEGG官⽹（）中，将通路分成了7类：
（代谢）
（遗传信息处理）
（环境信息处理）
（细胞过程）
（⽣物系统）
（⼈类疾病）
（药物开发）
每⼀类⼜包含若⼲个⼦类，每个⼦类包含了若⼲个pathway。因此与gene ontology类似，我们可以根据上⾯的6类（⼀般不包括最后⼀个“药物开发”）将pathway分类汇总，做出⼀个分类汇总图，这样可以在更上⼀层级研究pathway。主要应⽤于特殊物种的denovo测序注释，也可以应⽤于我们常规的pathway富集分析。
页⾯列出了⼏百个通路的所属关系，⼿⼯查询耗时耗⼒。微⽣信平台根据这些所属关系，开发了⼀个pathway分类在线绘图页⾯。我们来看看吧！
Pathway分类汇总例图
让我们⼀步⼀步来看这个图的做法！
1，打开绘图页⾯链接
Pathway富集结果分类图页⾯
若⼩伙伴没还没有注册，赶紧注册上车，带你领略100多款科研图的使⽤和绘制，页⾯下⽅有测试账号哦！2，整理输⼊数据，并粘贴
我们以clusterprofiler结果为例，获得的kegg富集结果如下：
我们将标黄的两贴单独拎出来，粘贴到页⾯输⼊框中
粘贴数据3，选择参数，提交
svg图
参数主要包括字体⼤⼩和颜⾊，可以选择每⼀个⼤类的颜⾊。
参数和颜⾊4，调整及出图
提交后约3s钟，会在右侧出图。
结果图⽚
可以看出，我们这个数据集中有两个通路的名字跟官⽹的不⼀样，要⾃⼰搜索，并修改数据，重新提
交。
例如，经过查询，我们把
Chagas disease (American trypanosomiasis) 改成 Chagas disease
Cell adhesion molecules (CAMs) 改成Cell adhesion molecules
然后重新提交，即可出来最终的图。并且我们提供了4种格式图⽚供下载，包括两种⽮量图（SVG和PDF）和两种标量图（PNG和tiff）。其中⽮量图可以使⽤AI或者inkscape根据⾃⼰的喜欢进⾏编辑调整。
是不是很简单⽅便呢？赶紧来试试吧！

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