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残基

植物Myb转录因子的研究进展

2024-04-22 16:15:42

s铂O量e嘲noml警cs与an擘dA乏p嵩pl跫edBm—lo—gywww.genoappibi01.orgIX)I:10.3969/gab.028.000365有超过80个M),b转录因子(gabinowiczeta1..1999),而棉花中发现大约有200个Myb转录因子(Cedronieta1.,2003)。功能研究表明,M如参与了植物次生代谢(UimariandStrommer,1997...

PDB格式详解(中文版)

2024-01-27 12:02:17

Pdb格式详解PDB格式是包含原子坐标文件的标准。PDB格式包含线性信息在一个文本文件里。文件中每一行的信息叫做一个“记录”。一个文件通常包含几个不同类型的records,并且按照特定的顺序排列来描述一个结构。下表描述了选择性的记录的类型。旧的PDB格式或许没有完全加入到新的格式规格。从大多数使用者的力场出发,旧文件和新文件最大的不同在ATOM和HETATM的温度因素。此外,一些空白的区域,就如同...

PDB文件详解

2024-01-27 12:02:05

PDB文件详解PDB格式文件对大部分做模拟和计算的人来说都 很熟悉,但其中各个参数的意义很多人并不是很了解。从网上搜集了一些文章,结合自己的知识来对PDB文件中各个参数的意义做个解释:REMARK 该记录用来记述结构优化的方法和相关统计数据。如用 Refmac进行结构优化,该记录将自动插入输出的PDB。CRYST1 (NMR除外)该记录用来记述晶胞结构参数 (a, b, c, α, β, γ, 空...

PDB文件的格式

2024-01-27 12:01:19

PDB⽂件的格式PDB⽂件⾥⾯的信息有严格的格式的。各⾏数据,如标识、原⼦名、原⼦序号、残基名称、残基序号等,不仅要按照严格的顺序书写,⽽且各项所占的空符串长度,及其所处的各⾏的位置都是严格规定的。有关PDB⽂件的格式的全部说明可以在⽹站上查询。对于使⽤分⼦模拟⽽⾔,最需要关⼼的是记录着原⼦坐标的信息。⼀个PDB⽂件可以是按着这样的格式写的:Example1     ...

linux下Rosetta从头预测软件的安装使用

2023-12-29 03:23:46

1、(平台:Fedora10,gcc 版本为4.3.2)安装 Rosetta 需要另外一个名为 scons 的软件,到 下载 rpm 包,在根口令下安装(输入:rpm -ivh 软件包名称) 进入 /,点击 software,在 Download Rosetta Software 下方点击 Acade...

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