基因
结核分支杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因研究
重庆医科大学硕士学位论文结核分支杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因研究姓名:***申请学位级别:硕士专业:呼吸病学指导教师:***20100501结核分支杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因研究摘要目的构建结核分支杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因消减文库,分离结核分支杆菌差异表达cDNA片段并分析其功能,筛选出致病株独有的保护性抗原编码基因,借助质粒载体将其表达于人类口腔非致病性...
Bac to Bac
Bac-to-Bac杆状病毒表达系统是一种快速、高效产生重组苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(AcNPV)的技术(Luckow et al., 1993),利用细菌转座子原理,在大肠杆菌内就能完成重组病毒的构建,取名为Bac-to-Bac表达系统,意即从细菌(bacterium)到杆状病毒(baculovirus),革命性地改变了重组昆虫杆状病毒的构建方法。 其基本原理为:将一个改造后的AcN...
如何做GO与KEGG分析-DAVID使用教程
如何做GO与KEGG分析-DAVID使⽤教程这期番茄君为⼤家带来如何利⽤DAVID在线数据库做GO与KEGG分析。1.点击⽂末“阅读全⽂”,获取DAVID在线数据库⽹址链接。打开后如下(部分):2.点击上图中红⾊框⾥的Start Analysis。如下:3.上传基因。Step1: Enter Gene List有两个选项可以上传基因:第⼀种⽅法是在A: Paste a list的⽩⾊框⾥输⼊基因名...
线粒体基因组数据的分析方法和软件_李雪娟
应用昆虫学报Chinese Journal of Applied Entomology 2013,50(1):298-304.DOI :10.7679/j.issn.2095-1353.2013.040线粒体基因组数据的分析方法和软件*李雪娟杨婧王俊红任倩俐李霞黄原**(陕西师范大学生命科学学院西安710062)批处理文件注释摘要线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。...
生物信息编程训练十题
生物信息编程训练题目编程语言要求:C/C++, perl, python, java.共十个题目。前五道,属较低难度等级,新手;后五道,属较高难度等级,高手。1. 编写一个模拟基因DNA序列或者protein序列的程序。要求能够产生指定长度和条数的随机序列,输出到fasta格式文件中。无论DNA还是protein序列,均需尽可能符合真实的基因序列特征。2.编写一个测序数据...
体感应
费氏弧菌Vibrio fischeri 体感应系统首先是在海洋细菌费氏弧菌,费氏弧菌定殖于夏威夷鱿鱼的发光器官内,当细菌达到一定的密度后,就会诱导发光基因的表达。细菌的生物发光为鱿鱼提供光源,掩盖其影子来保护自身。同时,细菌也获得一个合适的栖息场所。Nealson等在1970 年首次报道了该菌菌体密度与生物发光呈正相关,该发光现象受细菌本身的体感应调节系统(Quorum-Sensing Sys...
山新杨钾离子通道基因PdbSKOR的克隆与功能分析
Vol. 57,No. 1Jan. ,202 1第57卷第1期2021年1月林 业 科 学SCIENTIA SILVAE SINICAEdoi :10. 11707/j.l001-74熒.20210106山新杨钾离子通道基因PdbSKOR 的克隆与功能分析王力敏"陈亚辉・2杨庆山3,曲日涛5姜姜2张金池2(1.鲁东大学农林工程研究院 烟台264025; 2.南京林业大学林学...
基因数据分析的主流软件
基因数据分析的主流软件在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于表达序列同源范围的程序,在基因组注释中的作用日益显著。即使在稀少基因或组织特异性表达的基...
一文掌握GO和pathway分析
⼀⽂掌握GO和pathway分析原⽂链接:原⽂链接在做转录组分析的时候,如何从众多差异基因中筛选出⽬标基因呢?下⾯就以⼀篇⽂章为例,来看看⽤什么⽅法可以缩⼩差异基因范围,使⽬标基因挑选更有针对性。⽂章案例Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small celllung carcinoma in nonsmoking women相...
体遗传学知识点归纳
体遗传学知识点归纳I.体基本概念体:同一物种生活在某一地区内的、能够相互交配的个体体遗传学:研究体中基因的分布及逐代传递中维持和改变基因频率、基因型频率的因素基因库(gene pool):一个体所具有的全部遗传信息基因频率:某一等位基因占该基因座位全部等位基因的比率基因型频率:某一基因型的所有个体在所研究体中所占的比例,由基因型频率推 算等位基因频率。体的遗传结构:基因库中各种基...
研究生学术英语读写教程 Unit 6 Text A
In the late 17th century, the Dutch scientist Antonie van Leeuwenhoek created a new type of microscope lens and brought an entire world of tiny organisms into focus. Looking at his own dental plaque,...
ryuyan方差分析_R语言中实现方差分析及其可视化
ryuyan⽅差分析_R语⾔中实现⽅差分析及其可视化⽅差分析(Analysis of Variance,简称ANOVA),⼜称“变异数分析”,是R.A.Fisher发明的,⽤于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验。 由于各种因素的影响,研究所得的数据呈现波动状。 造成波动的原因可分成两类,⼀是不可控的随机因素,另⼀是研究中施加的对结果形成影响的可控因素。⽅差分析分类:⽅差分析常⽤的为单因素⽅差分...
基因相关性+药物敏感性分析
基因相关性+药物敏感性分析①⾼低风险组某基因表达量差异分析输⼊⽂件symbol.png输⼊⽂件risk.png输⼊⽂件risk.png#Gemcitabine, GNF.2, GSK269962A, GSK.650394, GW.441756, GW843682X, Imatinib, IPA.3,#JNJ.26854165, JNK.9L, JNK.Inhibitor.VIII, JW.7.52...
limit的过去式与现在分词
limit的过去式与现在分词过去式与现在分词是我们学习英语动词时必须掌握的一个知识,那limit的过去式与现在分词是什么呢?下面是 为你整理的limit的过去式与现在分词,希望大家喜欢!过去式: limited现在分词: limiting现在分词limiting造句1. The conditions laid down to me were not too limiting.给我规定的条件还不算...
bioconductor包的使用方法
Bioconductor包的使用方法1. 什么是Bioconductor包?Bioconductor是一个用于生物信息学和计算生物学的开源软件项目,旨在提供生物学数据的分析和可视化工具。Bioconductor项目提供了大量的R语言包,用于处理、分析和可视化生物学数据。这些包涵盖了多个领域,包括基因表达、基因组学、蛋白质组学、代谢组学等。Bioconductor包的使用方法可以帮助生物学家、生物信...
KEGG使用教程
最近要学KEGG,先粘2个有用的内容存档。www.lllll/?wz457.html以下是我归纳出的使用KEGG方法敲门,供给大家参考使用KEGG数据库一个主要用途就是查询分析pathway,然而直接通过网页打开的是一个图片形式的数据。如下介绍如何利用下载的数据,以及使用软件VisANT(首先需要安装java虚拟机,太大了请自己去网上下载)来分析KEGG数据。以人类MA...
小白实战课堂开课啦!手把手教你转录因子与靶基因预测操作~!
⼩⽩实战课堂开课啦!⼿把⼿教你转录因⼦与靶基因预测操作~!⼀⽂学会JASPAR数据库使⽤⽅法嗨,⼩伙伴们⼤家好!这⾥是每周⼀弘毅专栏,我志向⽤⼩⼩⽂字助⼒你的SCI发表之路。很多⼩伙伴在设计转录因⼦相关课题的时候经常会遇到这样⼀个问题,在已知靶基因的情况下怎么寻它上游的转录因⼦?或者是已知转录因⼦怎么到它可能参与调控的靶基因?本周给⼤家梳理的知识点和介绍的JASPAR数据库便是⽤来解决这两个问...
网页爬虫(超超简单的一个小例子)
⽹页爬⾍(超超简单的⼀个⼩例⼦)(⼀) ⽬标:在Uniprot中查询⼀系列基因编号(如图中第⼆列gene)对应的详细信息,基因编号以csv格式存储,输出的详细信息也存⼊csv中 (⼆) 思路: 查询了⼏个基因编号之后发现,⽹页的排版不会变化,唯⼀改变的是其具体内容,所以决定⾸先获取⽹页所有的内容,然后进⾏分析,从中提取出⾃⼰想要的信息(三) ⼯具: 基于python3,Be...
生物信息学数据库分类整理汇总
生物信息学数据库分类整理汇总1. Meta databases元数据库,合并不同来源的相关数据以更新的或更加方便的形式提供新的数据,通俗的讲就是数据库的数据库,代表性的数据库主要有以下几个:ConsensusPathDB 网址:/ 描述:分子功能互作数据库,基于32个公共数据库,整合了人类蛋白质相互作用,遗传相互作用信号,代谢,基因调控...
激动人心的英文翻译是什么
激动⼈⼼是⼀种让你想⼤声喊出来的那种感觉,那么激动⼈⼼⽤英语可以怎么表达呢?现在就⼀起来学习激动⼈⼼的英语知识吧。 激动⼈⼼的英⽂翻译 激动⼈⼼[jī dòng rén xīn] Stirring arouse sb.'s feeling; stir the hearts of man 激动⼈⼼的双语例句 1....
维恩画图软件用户手册
维恩画图软件用户手册V 1.0目录1引言 31.1编写目的 31.2背景 32用途 32.1功能 32.1.1.画图模块 32.1.1.数据输出模块 53运行环境 63.1硬设备 ...
量子遗传算法以及matlab实现
量⼦遗传算法以及matlab实现1、基本概念(1)量⼦遗传算法是量⼦计算与遗传算法相结合的智能优化算法,由K.H.Han等⼈提出,其将量⼦态、量⼦门、量⼦状态特性、概率幅等量⼦概念引⼊到遗传算法当中。量⼦遗传算法也是⼀种概率搜素算法,它采⽤量⼦位来表⽰基因。遗传算法的基因所表达的是某⼀确定的信息,⽽量⼦遗传算法中,由于量⼦信息的叠加性使量⼦位所表达的基因包含所有可能的信息。(2)在量⼦计算中,量⼦...
零基础大数据挖掘(三)--富集分析
零基础大数据挖掘(三)--富集分析“生信草堂号外,号外,号外你想和生信分析大神做好朋友么?你想认识更多爱好生信分析的小伙伴么?你想让自己的生信分析走上快车道么?那就赶快加入我们的生信交流吧!正确加入我们的模式是:添加我们的bioinformatics88为好友标注“加入生信草堂交流”java零基础该怎么学在里请大家注明自己本名,单位,研究领域便于小编管理freescience联盟&n...
金黄葡萄球菌临床株对利奈唑胺耐药性及耐药机制
金黄葡萄球菌临床株对利奈唑胺耐药性及耐药机制方颍;黄永禄;蔡加昌;林晓伟;张嵘;吕火烊【摘 要】目的 了解金黄葡萄球菌(金葡菌)临床株对利奈唑胺耐药性及耐药机制.方法 收集2011-2014年浙江省人民医院900株金葡菌,采用纸片扩散法测定利奈唑胺药敏,对筛选到的耐药菌株采用琼脂稀释法测定常用药物的最低抑菌浓度(MIC),同时对其耐药基因cfr、optrA、23S rRNA基因第5功能区进行P...
GO注释和富集分析概念介绍
GO注释和富集分析概念介绍什么是富集分析?当我们获得了⼀批⽣物数据时,例如转录组的数据,蛋⽩质组的数据,其中必然要做不同样本之间的差异基因分析这⼀步,例如空⽩对照组与实验组的差异基因或蛋⽩分析。在得到差异的基因或蛋⽩列表后,这个时候可能还会遇到⼀个问题,差异基因可能有很多,有⼏⼗个到上百个不等,如何对它们进⾏⽐较呢?这⼏⼗甚⾄上百差异基因或蛋⽩如何去呈现,这是⼀个问题,如果直接列张表,把所有的差异...
2021-07-04CRISPR-Cas9基因编辑原理详解
2021-07-04CRISPR-Cas9基因编辑原理详解CRISPR-Cas 系统(The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats-associated protein systems)是⼀个细菌及古细菌进化出来⽤以抵御病毒和质粒⼊侵的适应性机制。CRISPR-Cas 系统的⾼效基因组编辑功能已被应⽤于多种⽣物,包括...
新视野大学英语读写教程4课文翻译
UNIT 1艺术家追求成名,如同狗自逐其尾,一旦追到手,除了继续追逐不知还能做些什么。成功之残酷正在于它常常让那些追逐成功者自寻毁灭。对一名正努力追求成功并刚刚崭露头角的艺术家,其亲朋常常会建议“正经的饭碗不能丢!”他们的担心不无道理。追求出人头地,最乐观地说也困难重重,许多人到最后即使不是穷困潦倒,也是几近精神崩溃。尽管如此,希望赢得追星族追捧和同行赞扬之类的不太纯洁的动机却在激励着他们向前。享...
终于来了,特区先行!《深圳经济特区细胞和基因产业促进条例(征求意见...
终于来了,特区先⾏!《深圳经济特区细胞和基因产业促进条例(征求意见稿)》正式发布!2021年11⽉12⽇,深圳新兴领域重要⽴法《深圳经济特区细胞和基因产业促进条例(征求意见稿)》在深圳市⼈⼤常委会⽹站上公开征求意见。《条例(征求意见稿)》对细胞采集和储存⾏为进⾏了规范,对细胞和基因药物拓展性临床试验制度予以具体规定,并⿎励基因技术研发使⽤。药物拓展性临床试验内容摘要(全⽂在后⾯)第四章药物拓展性临...
生物信息学题库
■一、选择题:1.以下哪一个是mRNA条目序列号: A. J01536 ■. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB1345062.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是: ■. Unigene ...
干货:看了这篇以后不要再说看不懂Circos图了
⼲货:看了这篇以后不要再说看不懂Circos图了作者 | 杨振涛本⽂根据杨振涛 2018 年 5 ⽉ 12 ⽇在【第九届中国数据库技术⼤会】上的演讲内容整理⽽成。杨振涛vivo 互联⽹搜索团队负责⼈,专注于数据的存储、检索与可视化,以及软件过程改进;从基因序列数据分析到移动互联⽹搜索,已有 10 年从业经验。开源社区活跃分⼦,发起并组织 Elasticsearch 、 Redis 、 Jenkin...