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基因组

基因组学

2024-03-24 08:56:38

基因组:生物所具有的携带遗传信息的遗传物质的总和,是指生物细胞中所有的DNA,包括所有的基因和基因间区域。基因组学:研究基因组结构和功能的科学。指以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段,以生物体内全部基因为研究对象,在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。C值:指一个单倍体基因组中DNA的总量,以基因组的碱基对来表示。每个细胞中以皮克(pg,10-...

STS STR ITS SDs总结

2024-03-24 08:56:14

1、STS(序列标签位点),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。用途:这种序列在染体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,因...

生物信息名词解释

2024-03-24 08:55:08

逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。全基因组鸟法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。单核苷酸多态性(SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。遗传图谱又称连锁图谱,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在体中...

现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)

2024-03-24 08:54:19

现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)一、绪论两个经典实验1、肺炎球菌在老鼠体内的毒性实验:先将光滑型致病菌(S型)烧煮杀活性以后、以及活的粗糙型细菌(R型)分别侵染小鼠发现这些细菌自然丧失了治病能力;当他们将经烧煮杀死的S型细菌和活的R型细菌混合再感染小鼠时,实验小鼠每次都死亡。解剖死鼠,发现有大量活的S型细菌。实验表明,死细菌DNA进行了可遗传的转化,从而导致小鼠死亡。2、T2噬菌体感染大肠杆菌:...

分子标记技术及其进展

2024-03-24 08:53:32

(接封3)[15]T ischer E ,M itchell R ,Hartman T ,et al .The human gene for vascular en 2dothelia growth factor ,multiple protein forms are encoded through alternative zx on splicing[J ].J.Biol.Chem ,1991,...

现代分子生物学名词解释朱 玉贤

2024-03-24 08:53:19

ABC模型:即控制花形态发生的模型。该模型把四轮花器官同时发生作为基本前提,强调花形态突变体产生不同花器官的生理位置变化。该模型中正常花的四轮结构的形成是由三组基因A、B、C共同作用完成的,每一轮花器官特征的决定分别依赖于A、B、C三组基因中的一组或两组基因的正常表达oA组基因控制萼片、花瓣的发育,B组基因控制花瓣、雄蕊的发育,C组基因控制雄蕊、心皮的发育oA、C组基因互相拮抗,抑制对方在自身所控...

精准医疗中基因序列分析与诊断算法研究

2024-03-24 08:52:16

精准医疗中基因序列分析与诊断算法研究随着科技的不断进步和生命科学的快速发展,精准医疗正逐渐成为现代医学的重要研究领域。精准医疗旨在通过对个体基因信息的分析和理解,为每位患者量身定制最佳的方案,提高疾病的预防、诊断和效果。基因序列分析与诊断算法作为精准医疗的核心技术之一,在疾病的分子机制解析、个性化和基因检测等方面发挥着重要的作用。基因序列分析是指对个体基因组DNA序列进行测序和分析的过...

综述CLINTRANSLMED:非编码RNA(ncRNA)调控轴在动脉粥样硬化进展中的作...

2024-03-24 08:52:03

综述CLINTRANSLMED:⾮编码RNA(ncRNA)调控轴在动脉粥样硬化进展中的作⽤编译:KT!,编辑:景⾏、江舜尧。原创微⽂,欢迎转发转载。导读⼈类基因组测序项⽬发现了细胞RNA世界的丰富多彩,并打开了具有调控或结构潜能的短或长⾮编码RNA(潜藏的转录组学)的⼤门,同时也转变了对病理性基因从编码RNA到⾮编码RNA的认知。因此,⽬前疾病风险评估增加了对新RNA表达的评估,如⼩microRN...

生物信息-名词解释

2024-03-24 08:32:08

逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。全基因组鸟法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。单核苷酸多态性(SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。遗传图谱又称连锁图谱,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在体中...

基因组学复习题

2024-03-24 08:28:59

第1章1)什么是C-值悖理?什么是N-值悖理?C-值悖理:生物基因组的大小同生物进化所处地位的高低无关的现象。N-值悖理:基因数目与进化程度或生物复杂性的不对应性,称之为N值悖理2)什么是序列复杂性? 基因组中不同序列的DNA总长,用bp 表示。3)RNA分子有哪些种类?mRNA tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干扰RNA4)不编码蛋白质的RNA包括哪些类...

DNA分子标记技术及其应用_白玉

2024-03-24 08:28:35

DNA分子标记技术及其应用白玉 (首都师范大学生命科学学院,北京100037)摘要 对RFLP、R APD、AFLP、SSR、ISSR等常用的DNA分子标记技术以及其他几种新兴的标记技术(SNP、E ST等)的原理、特点进行了综述,认为利用DNA分子标记技术来鉴定品种具有客观、准确、快速的特点,且可鉴定形态上很难或者根本无法鉴别的品种。分子标记技术已成为品种鉴定技术领域的主流和发展趋势。关键词 D...

分子生物学试题---染体与DNA

2024-03-24 08:28:08

第二章 染体与DNA 第二章一、名词解释:一、名词解释:1、C值:一种生物单倍体基因组DNA的总量。的总量。2、C值反常现象:也称C值谬误。它是指C值往往与种系进化的复杂程度不一值。致,某些低等生物却具有较大的C值。3、重叠基因:即同一段DNA能携带两种不同蛋白质的信息。能携带两种不同蛋白质的信息。4、断裂基因:真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再...

DNA分子标记

2024-03-24 08:27:56

DNA分子标记技术及其应用白玉 (首都师范大学生命科学学院,北京100037)摘要 对RF LP、RAPD、AF LP、SSR、ISSR等常用的DNA分子标记技术以及其他几种新兴的标记技术(S NP、EST等)的原理、特点进行了综述,认为利用DNA分子标记技术来鉴定品种具有客观、准确、快速的特点,且可鉴定形态上很难或者根本无法鉴别的品种。分子标记技术已成为品种鉴定技术领域的主流和发展趋势。关键词 ...

南开大学生物化学 课件

2024-03-24 08:21:58

第十二章 基因组学与医学第一节 基因组学概念及研究范畴基因组学概念基因组(genome):泛指一个细胞或一个生物体的全部遗传信息。在真核生物,基因组是指一套(单倍体)染体DNA。 基因组学(genomics):从基因组水平(分子整体水平)研究遗传的学科。主要是发展和应用DNA制图、测序新技术及计算机程序,分析生命体全部基因组的结构及功能。  人类基因组计划(HGP)及基因组学概念的提出...

人类基因组多态性及其在健康和疾病中的作用

2024-03-24 08:20:41

人类基因组多态性及其在健康和疾病中的作用在人类物种中,基因组多态性是指在人类种中存在的多种基因组序列变异的现象。这种变异会影响个体的外貌、生物学特性、代谢能力和健康状态。基因组多态性在人体内起到了不可忽视的作用。本文将讨论基因组多态性在健康和疾病中的作用。一、基因的分类人体内的基因可以分为常染体基因和性染体基因。常染体基因是归属于非性染体上的基因,每个人有两个常染体基因,一个来源于母亲...

SNP及检测技术

2024-03-24 08:17:39

1定义:单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的...

不可不看的CNV全解析

2024-03-24 08:15:31

不可不看的CNV全解析导读拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段拷贝数的增加或减少,主要表现为亚显微水平的缺失或重复。这种变异既有个体的正常多态性变异,也有致病性的变异[1]。目前,按照CNV是否致病可分为致病性CNV、非致病性CNV和不明临床意义CNV。对于如何解读检测出的CNV临床意义,长期困扰着临床医生...

遗传学中的人类基因组多态性

2024-03-24 07:51:16

遗传学中的人类基因组多态性人类的基因组是指人类细胞中所有基因的总和,也是遗传学中研究的重要对象。基因组中有许多基因是不同的,而这些基因的变异就是多态性。人类基因组多态性主要表现为人之间和个体之间的差异。这些差异包括单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失多态性(indel)、结构变异、单倍型和等位基因频率等。单核苷酸多态性(SNP)单核苷酸多态性是指基因组中存在的单个核苷酸差异。SNP是导致性状变异...

如何进行多基因组比对共线性分析

2024-03-09 09:06:57

如何进⾏多基因组⽐对共线性分析如何进⾏多基因组⽐对和共线性分析pf202009191、⽐对基因组⼀个基因组⽐对的简单⽤户图形界⾯是Mauve。双击启动软件后,只需从“File”菜单中选择“Align…”或“Align with progressiveMauve…”。然后Mauve 就提供⼀个⽐对的对话框:下⾯部分的描述是对话框中各个输⼊参数的设置。1.1使⽤⽐对对话框1.1.1序列⽂件的输⼊格式基...

现代人体内发现渗入古人类基因:是毒药还是宝藏?

2024-03-02 18:14:11

现代人体内发现渗入古人类基因:是毒药还是宝藏?archaic克利夫兰自然历史博物馆中,现代人(左)与尼安德特人(右)颅骨对比。图源:hairymuseummatt/Wikimedia Commons- 引 言 -世界上现存的人类都属于智人(Homo sapiens),但在我们智人的体内里,还有着直系祖先之外的其他古人类基因。撰文丨何纾宇责编丨戴 威●  ●  ●1980年,考古...

中度重复序列简介

2024-03-02 16:43:06

中度重复序列简介∙1拼音∙2注解1拼音zhōng dù zhòng fù xù liè2注解中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万(<105)次的重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序,但慢于高度重复顺序。少数在基因组中成串排列在一个区域,大多数与单拷贝基因间隔排列。依据重复顺序的长度,中度重复顺序可分为两种类型。 (1)短分散片段(short interspersed repeated...

bam统计测序量

2024-02-06 23:37:21

bam统计测序量BAM(Binary Alignment Map)文件是存储基因组序列比对结果的二进制格式文件,通常用于存储 DNA 或 RNA 测序数据的比对结果。在测序数据分析中,可以通过 BAM 文件来进行测序量的统计。要统计测序量,可以使用一些工具和方法来处理 BAM 文件,以下是一般的流程:在线二进制转换1. 提取基因组覆盖度:通过解析 BAM 文件中的比对信息,可以计算每个碱基被覆盖的...

福利常用商业化载体的图谱解析(Ⅱ)—详解

2024-01-31 21:39:28

福利常用商业化载体的图谱解析(Ⅱ)—详解1  载体必需元件复制起始位点(Ori)+ 筛选标签(抗性基因等)minimal Minimal Plasmid Made by Synbio Center: pSC0331A 目前几乎所有的商业化质粒载体的克隆系统都是E.coli(大肠杆菌),因为在丰富培养基中E.coli生长非常快,20 min内就可以复制一代,所以我们通常是在E.coli中完...

KEGG简介

2024-01-27 12:08:56

KEGG简介  KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组信息数据库,它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。基因组信息存储在GENES数据库 里,包括完整和部份测序的基因组序列;更高级的功能信息存储在PATHWAY数据库里,包括图解的细胞生化进程如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期,还包 括同系保守...

fin造句

2024-01-15 04:17:53

fin造句1、The fish's tail fin was hurt.这条鱼的尾鳍受伤了。2、Including the horizontal stabilizer fin and the vertical finretractable.尾翼包括水平尾翼和垂直尾翼。3、The first pectoral fin ray of...

多重耐药鲍曼不动杆菌AbaR型耐药岛的多样性

2024-01-12 08:02:51

多重耐药鲍曼不动杆菌AbaR型耐药岛的多样性闫中强;沈定霞【摘 要】@@ Fournier等[1]对鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii,AB)耐药株AYE和敏感株SDF的全基因组序列进行比较分析后,发现在多重耐药鲍曼不动杆菌(multidrug resistance A.baumannii,MDRAB)菌株AYE中,有大小为86kb的耐药岛,命名为AbaR1.迄今为止,已...

病毒的分类与命名

2024-01-04 02:38:51

病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。为了力求分类和命名的统一,1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会(I...

线粒体基因组数据的分析方法和软件_李雪娟

2023-12-30 16:17:50

应用昆虫学报Chinese Journal of Applied Entomology 2013,50(1):298-304.DOI :10.7679/j.issn.2095-1353.2013.040线粒体基因组数据的分析方法和软件*李雪娟杨婧王俊红任倩俐李霞黄原**(陕西师范大学生命科学学院西安710062)批处理文件注释摘要线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。...

KEGG使用教程

2023-12-20 09:45:38

最近要学KEGG,先粘2个有用的内容存档。www.lllll/?wz457.html以下是我归纳出的使用KEGG方法敲门,供给大家参考使用KEGG数据库一个主要用途就是查询分析pathway,然而直接通过网页打开的是一个图片形式的数据。如下介绍如何利用下载的数据,以及使用软件VisANT(首先需要安装java虚拟机,太大了请自己去网上下载)来分析KEGG数据。以人类MA...

生物信息学数据库分类整理汇总

2023-12-18 06:55:46

生物信息学数据库分类整理汇总1. Meta databases元数据库,合并不同来源的相关数据以更新的或更加方便的形式提供新的数据,通俗的讲就是数据库的数据库,代表性的数据库主要有以下几个:ConsensusPathDB 网址:/ 描述:分子功能互作数据库,基于32个公共数据库,整合了人类蛋白质相互作用,遗传相互作用信号,代谢,基因调控...

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