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系统树分枝上的Bootstrap值是什么

2024-01-30 12:10:52

系统树分枝上的Bootstrap值是什么?Felsenstein(1985)的自展检验(Bootstrap检验)是最常用来检验一个推断树可靠性的检验,这种检验是采用自展重复抽样的方法来评估一个推断树的可靠性。以一个alignment为例,首先使用某种建树的方法,如NJ法,MP和ML法,从数据集中构建一个原始树。现在使用自展重复抽样技术来检验这棵树的可靠性。在自展重复抽样时,n个核苷酸位点被随机地从...

生物信息学复习题及答案

2024-01-15 10:08:03

、名词解释:1.生物信息学: 研究大量生物数据复杂关系的学科,其特征是多学科交叉,以互联网为媒 介,数据库为载体。 利用数学知识建立各种数学模型 ; 利用计算机为工具对实验所得大量生 物学数据进行储存、检索、处理及分析,并以生物学知识对结果进行解释。2.二级数据库: 在一级数据库、 实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来, 是对 生物学知识和信息的进一步的整理。序列格式:是将DNA或者蛋白...

Cervus教程

2023-12-29 14:02:21

一、CERVUS用于体遗传学分析1.先将数据输入excel表格中。SSR的输入格式如图1图1搭建ssr服务器教程Individual一列指的是某一体中的个体编号;sex指编号对应个体的性别,这一列可有可无;20a,20b两列表示的是编号为20的微卫星位点在一个个体中的两个等位基因。用0,0表示没有数据  或者测不出来或者这个位点丢失。2.将excel中的数据转化为文本文件格式,如图2...

小白实战课堂开课啦!手把手教你转录因子与靶基因预测操作~!

2023-12-19 18:07:15

⼩⽩实战课堂开课啦!⼿把⼿教你转录因⼦与靶基因预测操作~!⼀⽂学会JASPAR数据库使⽤⽅法嗨,⼩伙伴们⼤家好!这⾥是每周⼀弘毅专栏,我志向⽤⼩⼩⽂字助⼒你的SCI发表之路。很多⼩伙伴在设计转录因⼦相关课题的时候经常会遇到这样⼀个问题,在已知靶基因的情况下怎么寻它上游的转录因⼦?或者是已知转录因⼦怎么到它可能参与调控的靶基因?本周给⼤家梳理的知识点和介绍的JASPAR数据库便是⽤来解决这两个问...

canal常见问题总结

2023-12-18 03:55:14

canal常见问题总结问题⼀:ERROR canal.sql.MysqlEventParser - dump address /192.168.1.50:3306 has an error, retrying. caused ption.CanalParseException...

基因组与Python--PyVCF好用的vcf文件处理器

2023-11-29 18:38:17

基因组与Python--PyVCF好⽤的vcf⽂件处理器vcf⽂件的全称是variant call file,即突变识别⽂件,它是基因组⼯作流程中产⽣的⼀种⽂件,保存的是基因组上的突变信息。通过对vcf⽂件进⾏分析,可以得到个体的变异信息。嗯,总之,这是很重要的⽂件,所以怎么处理它也显得⼗分重要。它的⽂件信息如下:⽂件的开头是⼀堆以“##”开始的注释⾏,包含了⽂件的基本信息。然后是以“#”开头的⼀...

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