序列
DNA序列的生物信息学分析
DNA序列的生物信息学分析生物信息学是对生物学数据进行处理、分析和解释的跨学科领域。在生命科学和医学研究中,生物信息学分析是至关重要的工具,可用于理解基因序列、蛋白质结构、基因组功能等方面。DNA序列是生物信息学分析的核心内容之一,本文将围绕DNA序列的生物信息学分析展开。DNA序列是基因组的基本单位,可以采集并以文本文件的形式储存。生物信息学分析DNA序列的主要方法包括序列比对、基因注释、基因功...
叶绿体的基因组学及其功能分析
叶绿体的基因组学及其功能分析叶绿体是植物细胞中的一种细胞器,它是光合作用的场所,是植物获得能量、制造营养物质的重要场所。叶绿体具有自主繁殖的能力,其基因组是研究叶绿体发育和生长的重要课题之一。随着基因测序技术的发展和应用,叶绿体基因组的研究正在变得越来越深入和细致,本文就叶绿体基因组学及其功能分析进行一些探讨。一、 叶绿体基因组的特点叶绿体基因组是植物细胞中较为稳定的遗传物质,其大小比较小,一般仅...
简述荧光定量pcr的用途
简述荧光定量pcr的用途荧光定量PCR(qPCR)是一种通过测量DNA分子在PCR反应过程中的指数增长来定量目标序列的技术。与常规PCR相比,qPCR具有更高的灵敏度、更广的动态范围和更准确的结果。由于其高效性和可靠性,qPCR在许多生命科学领域中得到广泛应用。荧光定量PCR的主要用途之一是基因表达分析。通过检测特定基因的mRNA水平,我们可以了解基因在不同组织、不同生理状态或不同疾病中的表达水平...
基因组的比较和功能分析
基因组的比较和功能分析随着现代生物学的发展,基因组编码的信息已成为解开生命奥秘的重要工具。基因组比较和功能分析是基因组学研究的重要内容。基因组比较可以揭示生物物种间的遗传变异和进化关系,功能分析有助于揭示基因的功能和调控机制。本文将介绍基因组比较和功能分析的基本原理和应用。多态性的作用一、基因组比较基因组比较是将两个或多个物种的基因组进行比较和分析,以揭示遗传变异和进化关系的过程。基因组比较可以采...
功能基因多样性研究概述
功能基因多样性研究概述本⽂转载⾃“美吉⽣物”,已获授权。不知道各位从事或即将从事微⽣物落功能⽣态学研究的⼤虾有没有留意到,通过功能基因扩增⼦测序技术研究微⽣物落功能的⽂章,⼀般多会将测序获得的核酸序列通过特定软件翻译成氨基酸序列后,再进⾏聚类、组成、⽐较、差异、关联和进化等⼀系列分析。⽐如这篇⽂章:DOI:10.1038/ismej.2017.97或者这篇:多态性的作用DOI:10.3389/...
基于生物信息学的新冠病毒变异分析与疫苗设计研究
基于生物信息学的新冠病毒变异分析与疫苗设计研究新冠病毒(SARS-CoV-2)的爆发引起了全球范围内的公共卫生危机。随着病毒的传播,人们发现它的变异趋势。为了更好地理解病毒的变异并设计有效的疫苗策略,生物信息学在新冠病毒变异分析和疫苗设计研究中发挥了重要作用。在新冠病毒的变异分析中,生物信息学技术被广泛应用。其中最常用的技术之一是全基因组比对。通过将不同地区、不同时间点病毒株的基因组序列进行比对分...
基因组学
基因组:生物所具有的携带遗传信息的遗传物质的总和,是指生物细胞中所有的DNA,包括所有的基因和基因间区域。基因组学:研究基因组结构和功能的科学。指以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段,以生物体内全部基因为研究对象,在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。C值:指一个单倍体基因组中DNA的总量,以基因组的碱基对来表示。每个细胞中以皮克(pg,10-...
STS STR ITS SDs总结
1、STS(序列标签位点),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。用途:这种序列在染体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,因...
分子生物学 重点
名词解释DNA的解链温度或称熔点:吸光度增加到最大值一半时的温度。内含子的可变剪接或变位剪接:在个体发育或细胞分化时可以有选择性地越过某些外显子或某个剪接点进行变位剪接,产生出组织或发育阶段特异性mRNA。核酶:指一类具有催化功能的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达。原位杂交:是用标记的核酸探针,经放射自显影或非放射检测体系,在组织...
生物信息名词解释
逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。全基因组鸟法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。单核苷酸多态性(SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。遗传图谱又称连锁图谱,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在体中...
现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)
现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)一、绪论两个经典实验1、肺炎球菌在老鼠体内的毒性实验:先将光滑型致病菌(S型)烧煮杀活性以后、以及活的粗糙型细菌(R型)分别侵染小鼠发现这些细菌自然丧失了治病能力;当他们将经烧煮杀死的S型细菌和活的R型细菌混合再感染小鼠时,实验小鼠每次都死亡。解剖死鼠,发现有大量活的S型细菌。实验表明,死细菌DNA进行了可遗传的转化,从而导致小鼠死亡。2、T2噬菌体感染大肠杆菌:...
分子标记技术及其进展
(接封3)[15]T ischer E ,M itchell R ,Hartman T ,et al .The human gene for vascular en 2dothelia growth factor ,multiple protein forms are encoded through alternative zx on splicing[J ].J.Biol.Chem ,1991,...
精准医疗中基因序列分析与诊断算法研究
精准医疗中基因序列分析与诊断算法研究随着科技的不断进步和生命科学的快速发展,精准医疗正逐渐成为现代医学的重要研究领域。精准医疗旨在通过对个体基因信息的分析和理解,为每位患者量身定制最佳的方案,提高疾病的预防、诊断和效果。基因序列分析与诊断算法作为精准医疗的核心技术之一,在疾病的分子机制解析、个性化和基因检测等方面发挥着重要的作用。基因序列分析是指对个体基因组DNA序列进行测序和分析的过...
综述CLINTRANSLMED:非编码RNA(ncRNA)调控轴在动脉粥样硬化进展中的作...
综述CLINTRANSLMED:⾮编码RNA(ncRNA)调控轴在动脉粥样硬化进展中的作⽤编译:KT!,编辑:景⾏、江舜尧。原创微⽂,欢迎转发转载。导读⼈类基因组测序项⽬发现了细胞RNA世界的丰富多彩,并打开了具有调控或结构潜能的短或长⾮编码RNA(潜藏的转录组学)的⼤门,同时也转变了对病理性基因从编码RNA到⾮编码RNA的认知。因此,⽬前疾病风险评估增加了对新RNA表达的评估,如⼩microRN...
apoB基因多态性研究意义
1.材料和方法1.1材料EcoRI、PCR扩增引物序列均参照Gajra B等[1],MspI位点的PCR扩增引物序列参照Soria LF[2],3'VNTR的PCR扩增引物序列参照罗超权等[3],引物的序列如下(由上海铂尚生物技术公司合成):EcoRI 5’primer:CTGAGAGAAGTGTCTTCGAAG3’primer:CTCGAAAGGAAGTGTAA TCACMspI 5’prime...
分子诊断名词解释
分子诊断名词解释分子诊断学:是临床检验诊断学的一个重要分支,它利用分子生物学技术来研究机体外源性和内源性生物大分子和大分子体系的存在、结构或表达调控的改变,从而为疾病的预测、预防和转归提供分子生物水平信息。开放阅读框ORF:始于密码子并终于终止密码子的一串密码子组成的核苷酸序列。密码子偏爱codon bias:在不同物种的基因中经常为某种氨基酸编码的只是其中的某一特定的密码子,这种现象叫做密码子偏...
T载体克隆的DNA序列分析
T载体克隆的DNA序列分析试验目的: 了解常规DNA序列分析技术(Sanger双脱氧法)的原理及操作步骤。 试验原理: 在分子生物学讨论中,DNA的序列分析是进一步讨论和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)创造的双脱氧链末端终止法和Maxam和Gilbert(1977)创造的化学降解法。两种方法在原理上差异很大,但都是依据核苷...
医学分子生物学简答总结(重点)
医学分子生物学简答题基因与基因组 真核生物基因组特点(1) 分子量很大的DNA 与蛋白质形成染体存在于核内。约30亿bp(2) 转录与翻译不同步,转录产物为单顺反子,功能相关基因分散排布,无操纵子结构。纵子结构。(3)基因组存在高比例的非码顺序)基因组存在高比例的非码顺序(non coding sepuence, NCS) (non coding sepuence, NCS)(4)大量重复序列(...
生物信息-名词解释
逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。全基因组鸟法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。单核苷酸多态性(SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。遗传图谱又称连锁图谱,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在体中...
SSR标记的原理
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 1.简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。2.SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫...
CAPS dCAPS SSLPs SCAR
什么是CAPS?酶切扩增多态性序列(C1eaved Amplified Polymorphic Sequences,CAPS)是一类以PCR为基础的共显性的分子标记,它的基本原理是先用已知位点的DNA序列去设计一套特异性的PCR引物(19~27bp)。然后应用这些去扩增该位点上的某一DNA片段;接着用一种专一性的限制性内切酶切割所得的扩增带并进行RFLP分析。1993年Konieczny和Ausu...
基因工程题库版--名词解释
各种题型确定题目重要题目候补题目不确定答案的题目试卷与题库重复题目名词解释同裂酶(同切点酶):有一些来源不同的限制酶识别的是同样的核苷酸靶序列,这类酶称为同裂酶。同尾酶:与同裂酶对应的一类限制性内切酶,它们来源各异,识别的靶序列也各不相同,但切割后都能产生相同的黏性末端,特称为同尾酶。测序酶:是经修饰过的T7噬菌体DNA聚合酶,是采用缺失的方法,从外切核酸酶结构域中除去28个氨基酸,这样使得T7D...
基因组学复习题
第1章1)什么是C-值悖理?什么是N-值悖理?C-值悖理:生物基因组的大小同生物进化所处地位的高低无关的现象。N-值悖理:基因数目与进化程度或生物复杂性的不对应性,称之为N值悖理2)什么是序列复杂性? 基因组中不同序列的DNA总长,用bp 表示。3)RNA分子有哪些种类?mRNA tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干扰RNA4)不编码蛋白质的RNA包括哪些类...
分子生物学试题---染体与DNA
第二章 染体与DNA 第二章一、名词解释:一、名词解释:1、C值:一种生物单倍体基因组DNA的总量。的总量。2、C值反常现象:也称C值谬误。它是指C值往往与种系进化的复杂程度不一值。致,某些低等生物却具有较大的C值。3、重叠基因:即同一段DNA能携带两种不同蛋白质的信息。能携带两种不同蛋白质的信息。4、断裂基因:真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再...
DNA分子标记
DNA分子标记技术及其应用白玉 (首都师范大学生命科学学院,北京100037)摘要 对RF LP、RAPD、AF LP、SSR、ISSR等常用的DNA分子标记技术以及其他几种新兴的标记技术(S NP、EST等)的原理、特点进行了综述,认为利用DNA分子标记技术来鉴定品种具有客观、准确、快速的特点,且可鉴定形态上很难或者根本无法鉴别的品种。分子标记技术已成为品种鉴定技术领域的主流和发展趋势。关键词 ...
分子生物学重要名词解释
分子生物学重要名词解释染体(chromosome):原指真核生物细胞分裂中期具有一定形态特征的遗传物质载体。现在这一概念已扩大为包括原核生物及细胞器在内的基因载体的总称。染质(chromatin):由DNA和蛋白质构成,在分裂间期染体结构疏松,称为染质。其实染质与染体只是同一物质在不同细胞周期的表现。常染质(euchromatin):是进行活跃转录的部位,呈疏松的环状,电镜下表现为浅...
南开大学生物化学 课件
第十二章 基因组学与医学第一节 基因组学概念及研究范畴基因组学概念基因组(genome):泛指一个细胞或一个生物体的全部遗传信息。在真核生物,基因组是指一套(单倍体)染体DNA。 基因组学(genomics):从基因组水平(分子整体水平)研究遗传的学科。主要是发展和应用DNA制图、测序新技术及计算机程序,分析生命体全部基因组的结构及功能。 人类基因组计划(HGP)及基因组学概念的提出...
第十五章可遗传的基因组变异与人类疾病易感性
第十五章可遗传的基因组变异与人类疾病易感性第一节基因组具有可遗传的变异和遗传多态性一.人类基因组中存在三条主要的遗传变异●基因组具有遗传所要求的稳定性和适应环境所要求的可变性,两者之间必须维持一个恰到好处的平衡,这样才能使生物体得以生存并世代相传。●人中的基因组变异主要体现在大量非编码的序列的重复序列、遍布与基因组的单个碱基变异,包括单核苷酸多态性(SNP)及点突变。(一)简单的短串联重复序列可...
如何用PCR法检测基因的多态性
如何用PCR法检测基因的多态性基因多态性PCR法(聚合酶链反应法)是一种广泛应用于分子生物学领域的基因检测技术。它能够在短时间内扩增特定序列的DNA片段,从而实现对基因多态性的检测。以下是使用PCR法检测基因多态性的步骤:1.设计引物首先,需要根据目标基因的序列设计引物(寡核苷酸序列)。引物一般包括一对前、后引物,它们各自与目标序列的两侧互补配对。引物的设计应考虑到目标基因区域的多态性,以确保引物...
基因检测相关概念
1、基因检测基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术,是取被检测者脱落的口腔黏膜细胞或其他组织细胞,扩增其基因信息后,通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,预知身体患疾病的风险,分析它所含有的各种基因情况,从而使人们能了解自己的基因信息,从而通过改善自己的生活环境和生活习惯,避免或延缓疾病的发生。基因检测可以诊断疾病,也可以用于疾病风险的预测。疾病诊断是用基因检测技术...